synapse-mcp

Was ist dieser MCP

Dies ist ein Model Context Protocol-Server, der RESTful API-Zugriff auf Synapse-Entitäten biomedizinischer Daten (Datensätze, Projekte, Dateien) und deren Annotationen mit OAuth2-Authentifizierungsunterstützung bietet.

Wie man diesen MCP verwendet

Der Server kann über pip oder Docker installiert und dann lokal ausgeführt oder auf Cloud-Diensten wie Fly.io bereitgestellt werden. Er bietet CLI- und API-Endpunkte für die Abfrage von Synapse-Daten und unterstützt sowohl direkte Authentifizierung als auch OAuth2-Flows.

Wofür dieser MCP verwendet werden kann

Der Synapse MCP-Server ermöglicht den programmatischen Zugriff auf in Synapse gespeicherte biomedizinische Forschungsdaten, einschließlich der Abfrage von Datensätzen, Tabellen und Metadaten in verschiedenen Formaten wie Croissant. Er erleichtert die Integration mit KI-Tools wie Claude für die Analyse biomedizinischer Daten.