synapse-mcp
Synapse MCP-Server für den Zugriff auf biomedizinische Daten mit OAuth2. synapse-mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by susheel. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 7 tools, including authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table, that an agent can call directly. It is categorized under Data/Storage and Tool/Server.
Was ist dieser MCP
Dies ist ein Model Context Protocol-Server, der RESTful API-Zugriff auf Synapse-Entitäten biomedizinischer Daten (Datensätze, Projekte, Dateien) und deren Annotationen mit OAuth2-Authentifizierungsunterstützung bietet.
Wie man diesen MCP verwendet
Der Server kann über pip oder Docker installiert und dann lokal ausgeführt oder auf Cloud-Diensten wie Fly.io bereitgestellt werden. Er bietet CLI- und API-Endpunkte für die Abfrage von Synapse-Daten und unterstützt sowohl direkte Authentifizierung als auch OAuth2-Flows.
Wofür dieser MCP verwendet werden kann
Der Synapse MCP-Server ermöglicht den programmatischen Zugriff auf in Synapse gespeicherte biomedizinische Forschungsdaten, einschließlich der Abfrage von Datensätzen, Tabellen und Metadaten in verschiedenen Formaten wie Croissant. Er erleichtert die Integration mit KI-Tools wie Claude für die Analyse biomedizinischer Daten.
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the synapse-mcp MCP server?
synapse-mcp is a Model Context Protocol server from susheel. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect synapse-mcp to my AI client?
Add synapse-mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does synapse-mcp provide?
synapse-mcp provides 7 tools: authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table.
Is synapse-mcp free to use?
synapse-mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
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