samtools_mcp

Was ist diese MCP

Diese MCP bietet eine standardisierte Schnittstelle für die Arbeit mit SAM/BAM/CRAM-genomischen Alignierungsdateien und bietet Funktionen zur Formatkonvertierung, Sortierung, Indizierung und statistischen Analyse.

Wie man diese MCP verwendet

Die MCP kann über Docker (empfohlen) oder eine lokale Installation genutzt werden. Sie stellt Python-Methoden für gängige Operationen wie view, sort, index und depth-Berechnungen für Alignierungsdateien bereit.

Wofür diese MCP verwendet werden kann

Diese MCP ermöglicht es Genomforschern, Alignierungsdateien programmgesteuert zu verarbeiten, einschließlich Formatkonvertierung, regionsspezifischer Analyse, Read-Filterung und der Generierung umfassender Statistiken für SAM/BAM/CRAM-Dateien.