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bio-workflows-microbiome-pipeline

GPTomics
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Diese Fähigkeit bietet eine End-to-End-16S/ITS-Amplikon-Analysepipeline, die FASTQ-Reads über ASV-Inferenz mit DADA2, Taxonomie-Zuordnung, Diversitätsanalyse und Differentialabundanztest mit ALDEx2 verarbeitet. Sie orchestriert mehrere mikrobiomspezifische Tools zu einem vollständigen Workflow für Entwickler. Nutzen Sie diese Fähigkeit, wenn Sie eine standardisierte, reproduzierbare Analyse für Mikrobiom-Sequenzierungsdaten von Rohdaten bis zu statistischen Ergebnissen benötigen.

Schnellinstallation

Claude Code

Empfohlen
Primär
npx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code
Plugin-BefehlAlternativ
/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkills
Git CloneAlternativ
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-workflows-microbiome-pipeline

Kopieren Sie diesen Befehl und fügen Sie ihn in Claude Code ein, um diese Fähigkeit zu installieren

GitHub Repository

GPTomics/bioSkills
Pfad: workflows/microbiome-pipeline
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