SKILL·1F36FF

bio-workflows-microbiome-pipeline

GPTomics
Aktualisiert 1 month ago
11 Ansichten
312
51
312
Auf GitHub ansehen
Testentestingautomationdata

Über

Diese Fähigkeit bietet eine End-to-End-16S/ITS-Amplikon-Analysepipeline, die FASTQ-Reads über ASV-Inferenz mit DADA2, Taxonomie-Zuordnung, Diversitätsanalyse und Differentialabundanztest mit ALDEx2 verarbeitet. Sie orchestriert mehrere mikrobiomspezifische Tools zu einem vollständigen Workflow für Entwickler. Nutzen Sie diese Fähigkeit, wenn Sie eine standardisierte, reproduzierbare Analyse für Mikrobiom-Sequenzierungsdaten von Rohdaten bis zu statistischen Ergebnissen benötigen.

Schnellinstallation

Claude Code

Empfohlen
Primär
npx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code
Plugin-BefehlAlternativ
/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkills
Git CloneAlternativ
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-workflows-microbiome-pipeline

Kopieren Sie diesen Befehl und fügen Sie ihn in Claude Code ein, um diese Fähigkeit zu installieren

GitHub Repository

GPTomics/bioSkills
Pfad: workflows/microbiome-pipeline
0
FAQ

Frequently asked questions

What is the bio-workflows-microbiome-pipeline skill?

bio-workflows-microbiome-pipeline is a Claude Skill by GPTomics. Skills package instructions and resources that Claude loads on demand, so Claude can perform bio-workflows-microbiome-pipeline-related tasks without extra prompting.

How do I install bio-workflows-microbiome-pipeline?

Use the install commands on this page: add bio-workflows-microbiome-pipeline to Claude Code as a plugin, or clone its repository into your skills directory, then restart Claude so it picks up the skill.

What category does bio-workflows-microbiome-pipeline belong to?

bio-workflows-microbiome-pipeline is in the Testing category, tagged testing, automation and data.

Is bio-workflows-microbiome-pipeline free to use?

Yes. bio-workflows-microbiome-pipeline is listed on AIMCP and free to install. It runs inside Claude, so no separate service account is required to use the skill itself.

Verwandte Skills

evaluating-llms-harness
Testen

Diese Claude Skill führt den lm-evaluation-harness aus, um LLMs über 60+ standardisierte akademische Aufgaben wie MMLU und GSM8K zu benchmarken. Sie wurde für Entwickler entwickelt, um Modellqualität zu vergleichen, Trainingsfortschritt zu verfolgen oder akademische Ergebnisse zu berichten. Das Tool unterstützt verschiedene Backends, einschließlich HuggingFace- und vLLM-Modelle.

Skill ansehen
cloudflare-cron-triggers
Testen

Diese Fähigkeit bietet umfassendes Wissen zur Implementierung von Cloudflare Cron Triggers, um Workers mithilfe von Cron-Ausdrücken zu planen. Sie behandelt das Einrichten periodischer Aufgaben, Wartungsjobs und automatisierter Workflows, während häufige Probleme wie ungültige Cron-Ausdrücke und Zeitzonenprobleme behandelt werden. Entwickler können sie zum Konfigurieren geplanter Handler, zum Testen von Cron-Triggers und zur Integration mit Workflows und Green Compute verwenden.

Skill ansehen
webapp-testing
Testen

Diese Claude Skill bietet ein Playwright-basiertes Toolkit zum Testen lokaler Webanwendungen durch Python-Skripte. Es ermöglicht Frontend-Verifizierung, UI-Debugging, Screenshot-Aufnahme und Log-Einblick bei gleichzeitiger Verwaltung von Server-Lebenszyklen. Nutzen Sie es für Browser-Automatisierungsaufgaben, führen Sie Skripte jedoch direkt aus, anstatt deren Quellcode zu lesen, um Kontextverschmutzung zu vermeiden.

Skill ansehen
finishing-a-development-branch
Testen

Diese Fähigkeit unterstützt Entwickler dabei, abgeschlossene Arbeiten zu finalisieren, indem sie testet, ob Tests bestehen, und dann strukturierte Integrationsoptionen präsentiert. Sie leitet den Workflow für das Zusammenführen von Code, das Erstellen von PRs oder das Bereinigen von Branches nach Abschluss der Implementierung. Nutzen Sie sie, wenn Ihr Code bereit und getestet ist, um den Entwicklungsprozess systematisch abzuschließen.

Skill ansehen