SKILL·30EEB5

hpc-runtime-doctor

HeshamFS
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Über

Diese Claude Skill diagnostiziert Laufzeit- und Scheduler-Probleme bei Hochleistungsrechen-(HPC) Materialsimulationen. Sie analysiert Probleme wie MPI/OpenMP-Layout, GPU-Nutzung, Environment-Module und Ressourcenfehlanpassungen, wenn Jobs in einem Cluster fehlschlagen oder unterdurchschnittlich performen. Nutzen Sie sie, um eine Diagnose, eine Umgebungscheckliste und einen sicheren Wiederholungsplan für Portabilitäts- und Leistungsprobleme zu erhalten.

Schnellinstallation

Claude Code

Empfohlen
Primär
npx skills add HeshamFS/materials-simulation-skills -a claude-code
Plugin-BefehlAlternativ
/plugin add https://github.com/HeshamFS/materials-simulation-skills
Git CloneAlternativ
git clone https://github.com/HeshamFS/materials-simulation-skills.git ~/.claude/skills/hpc-runtime-doctor

Kopieren Sie diesen Befehl und fügen Sie ihn in Claude Code ein, um diese Fähigkeit zu installieren

Dokumentation

HPC Runtime Doctor

Goal

Turn cluster symptoms into a resource-layout diagnosis, environment checklist, and safe retry plan.

Requirements

  • Python 3.10+
  • No external dependencies
  • Works on Linux, macOS, and Windows

Inputs to Gather

InputDescriptionExample
SchedulerSLURM, PBS, LSF, localslurm
Nodes/tasks/threadsRuntime layout2 nodes, 128 tasks, 2 threads
GPUsGPUs requested4
SymptomsObserved failureoom,killed,slow-gpu
MPI/OpenMP/GPU useParallel modesmpi+openmp+gpu
WalltimeRequested time12:00:00
ScratchWhether scratch is usedtrue

Decision Guidance

  • Check resource layout before changing physics settings.
  • Confirm module/compiler/MPI/CUDA consistency before debugging solver behavior.
  • Treat missing restart files and scratch cleanup as workflow failures, not physics failures.
  • For GPU jobs, confirm the executable was built with the requested accelerator backend.

Script Outputs

scripts/hpc_runtime_doctor.py emits:

  • resource_layout
  • diagnoses
  • environment_checks
  • retry_plan
  • scheduler_notes

Workflow

python3 skills/hpc-deployment/hpc-runtime-doctor/scripts/hpc_runtime_doctor.py \
  --scheduler slurm \
  --nodes 2 \
  --tasks 128 \
  --cpus-per-task 2 \
  --gpus 4 \
  --symptoms oom,slow-gpu \
  --uses-mpi \
  --uses-openmp \
  --uses-gpu \
  --json

Error Handling

Invalid resource counts stop with exit code 2. Unknown symptoms are preserved as custom items for human review.

Limitations

This skill does not query a live scheduler. It diagnoses from the submitted layout and symptoms.

Security

  • Inputs are scalar CLI values and booleans only.
  • The script does not execute scheduler commands or inspect environment variables.
  • The skill uses Bash only to run its bundled script.

References

  • See references/hpc_runtime_patterns.md for scheduler and runtime diagnosis patterns.

Version History

  • 1.0.0: Initial HPC runtime diagnosis skill.

GitHub Repository

HeshamFS/materials-simulation-skills
Pfad: skills/hpc-deployment/hpc-runtime-doctor
0
agent-skillsagentscli-toolscomputational-sciencellmmaterials-science
FAQ

Frequently asked questions

What is the hpc-runtime-doctor skill?

hpc-runtime-doctor is a Claude Skill by HeshamFS. Skills package instructions and resources that Claude loads on demand, so Claude can perform hpc-runtime-doctor-related tasks without extra prompting.

How do I install hpc-runtime-doctor?

Use the install commands on this page: add hpc-runtime-doctor to Claude Code as a plugin, or clone its repository into your skills directory, then restart Claude so it picks up the skill.

What category does hpc-runtime-doctor belong to?

hpc-runtime-doctor is in the Design category, tagged ai and api.

Is hpc-runtime-doctor free to use?

Yes. hpc-runtime-doctor is listed on AIMCP and free to install. It runs inside Claude, so no separate service account is required to use the skill itself.

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