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bio-gene-regulatory-networks-scenic-regulons

GPTomics
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Über

Diese Fähigkeit nutzt pySCENIC, um Genregulationsnetzwerke aus Einzelzell-RNA-seq-Daten abzuleiten, indem Transkriptionsfaktor-Regulone durch Co-Expressionsanalyse und Motivanreicherung identifiziert werden. Sie berechnet Regulon-Aktivitätsscores pro Zelle mit AUCell, um Entwicklern bei der Suche nach Masterregulatoren der Zellidentität zu helfen. Nutzen Sie sie, wenn Sie TF-Aktivitätsmuster analysieren oder Schlüsselregulationsnetzwerke in Einzelzell-Datensätzen entdecken müssen.

Schnellinstallation

Claude Code

Empfohlen
Primär
npx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code
Plugin-BefehlAlternativ
/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkills
Git CloneAlternativ
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-gene-regulatory-networks-scenic-regulons

Kopieren Sie diesen Befehl und fügen Sie ihn in Claude Code ein, um diese Fähigkeit zu installieren

GitHub Repository

GPTomics/bioSkills
Pfad: gene-regulatory-networks/scenic-regulons
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