samtools_mcp

¿Qué es este MCP?

Este MCP proporciona una interfaz estandarizada para trabajar con archivos de alineamiento genómico SAM/BAM/CRAM, ofreciendo capacidades de conversión de formato, ordenamiento, indexación y análisis estadístico.

Cómo usar este MCP

El MCP puede usarse mediante Docker (recomendado) o instalación local. Expone métodos en Python para operaciones comunes como view, sort, index y cálculos de depth en archivos de alineamiento.

Para qué sirve este MCP

Este MCP permite a los investigadores genómicos procesar archivos de alineamiento de forma programática, incluyendo conversión de formatos, análisis específico por regiones, filtrado de lecturas y generación de estadísticas completas para archivos SAM/BAM/CRAM.