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bio-read-qc-umi-processing

GPTomics
Actualizado 4 days ago
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Diseñodesign

Acerca de

Esta habilidad procesa datos de secuenciación con Identificadores Moleculares Únicos (UMIs) utilizando umi_tools para extraer códigos de barras y eliminar duplicados de lecturas, permitiendo un conteo preciso de moléculas. Es esencial para distinguir duplicados de PCR de variantes biológicas en aplicaciones como RNA-seq de células individuales o bibliotecas de bajo aporte. La herramienta proporciona flujos de trabajo basados en CLI para la extracción de UMIs, agrupación de lecturas y colapso de duplicados.

Instalación rápida

Claude Code

Recomendado
Principal
npx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code
Comando PluginAlternativo
/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkills
Git CloneAlternativo
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-read-qc-umi-processing

Copia y pega este comando en Claude Code para instalar esta habilidad

Repositorio GitHub

GPTomics/bioSkills
Ruta: read-qc/umi-processing
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