generate-statistical-tables
Acerca de
Esta habilidad genera tablas estadísticas listas para publicación en R utilizando paquetes como gt, kableExtra o flextable. Crea estadísticas descriptivas, salidas de regresión, tablas ANOVA, matrices de correlación y tablas con formato APA para trabajos académicos. Úsala cuando necesites formatear resultados estadísticos para documentos de Quarto o R Markdown.
Instalación rápida
Claude Code
Recomendadonpx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanacgit clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/generate-statistical-tablesCopia y pega este comando en Claude Code para instalar esta habilidad
Documentación
name: generate-statistical-tables description: > Publikationsreife statistische Tabellen mit gt, kableExtra oder flextable generieren. Umfasst deskriptive Statistiken, Regressionsergebnisse, ANOVA-Tabellen, Korrelationsmatrizen und APA-Formatierung. Verwenden, wenn deskriptive Statistiktabellen erstellt, Regressions- oder ANOVA-Ausgaben formatiert, Korrelationsmatrizen aufgebaut, APA-konforme Tabellen fuer akademische Arbeiten produziert oder Tabellen fuer Quarto- und R-Markdown-Dokumente generiert werden sollen. license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: reporting complexity: intermediate language: R tags: r, tables, gt, statistics, publication locale: de source_locale: en source_commit: 6f65f316 translator: claude-sonnet-4-6 translation_date: 2026-03-16
Statistische Tabellen generieren
Publikationsreife statistische Tabellen fuer Berichte und Manuskripte erstellen.
Wann verwenden
- Deskriptive Statistiktabellen erstellen
- Regressions- oder ANOVA-Ausgaben formatieren
- Korrelationsmatrizen aufbauen
- APA-konforme Tabellen fuer akademische Arbeiten produzieren
- Tabellen fuer Quarto/R-Markdown-Dokumente generieren
Eingaben
- Erforderlich: Statistische Analyseergebnisse (Modellobjekte, Zusammenfassungsdaten)
- Erforderlich: Ausgabeformat (HTML, PDF, Word)
- Optional: Stilrichtlinie (APA, zeitschriftenspezifisch)
- Optional: Tabellennummerierungsschema
Vorgehensweise
Schritt 1: Tabellenpaket waehlen
| Paket | Optimal fuer | Formate |
|---|---|---|
gt | HTML, Allzweck | HTML, PDF, Word |
kableExtra | LaTeX/PDF-Dokumente | PDF, HTML |
flextable | Word-Dokumente | Word, PDF, HTML |
gtsummary | Klinische/statistische Zusammenfassungen | Alle via gt/flextable |
Erwartet: Ein Tabellenpaket basierend auf dem Ausgabeformat und Anwendungsfall ausgewaehlt. Das gewaehlte Paket ist installiert und ladbar.
Bei Fehler: Wenn das benoetigte Paket nicht installiert ist, install.packages("gt") (oder das entsprechende Paket) ausfuehren. Fuer gtsummary muessen sowohl gt als auch gtsummary installiert sein.
Schritt 2: Deskriptive Statistiktabelle
library(gt)
descriptives <- data |>
group_by(group) |>
summarise(
n = n(),
M = mean(score, na.rm = TRUE),
SD = sd(score, na.rm = TRUE),
Min = min(score, na.rm = TRUE),
Max = max(score, na.rm = TRUE)
)
gt(descriptives) |>
tab_header(
title = "Table 1",
subtitle = "Descriptive Statistics by Group"
) |>
fmt_number(columns = c(M, SD), decimals = 2) |>
fmt_number(columns = c(Min, Max), decimals = 1) |>
cols_label(
group = "Group",
n = md("*n*"),
M = md("*M*"),
SD = md("*SD*")
)
Erwartet: Ein gt-Tabellenobjekt mit formatierten Mittelwerten, Standardabweichungen und Haeufigkeiten nach Kategorie gruppiert. Spaltenkoepfe verwenden korrekte statistische Notation (kursiv M, SD, n).
Bei Fehler: Wenn group_by() unerwartete Ergebnisse liefert, sicherstellen, dass die Gruppierungsvariable existiert und die erwarteten Stufen hat. Wenn fmt_number() einen Fehler wirft, sicherstellen, dass die Zielspalten numerische Daten enthalten.
Schritt 3: Regressionsergebnis-Tabelle
model <- lm(outcome ~ predictor1 + predictor2 + predictor3, data = data)
library(gtsummary)
tbl_regression(model) |>
bold_p() |>
add_glance_source_note(
include = c(r.squared, adj.r.squared, nobs)
) |>
modify_header(label = "**Predictor**") |>
modify_caption("Table 2: Regression Results")
Erwartet: Eine gtsummary-Regressionstabelle mit fett gedruckten p-Werten, Modellanpassungsstatistiken (R-Quadrat, N) in einer Quellnotiz und einer beschreibenden Ueberschrift.
Bei Fehler: Wenn tbl_regression() fehlschlaegt, sicherstellen, dass die Eingabe ein Modellobjekt ist (z.B. lm, glm). Wenn add_glance_source_note() Fehler wirft, pruefen, ob broom das Modell verarbeiten kann: broom::glance(model).
Schritt 4: Korrelationsmatrix
library(gt)
cor_matrix <- cor(data[, c("var1", "var2", "var3", "var4")],
use = "pairwise.complete.obs")
# Format lower triangle
cor_matrix[upper.tri(cor_matrix)] <- NA
as.data.frame(cor_matrix) |>
tibble::rownames_to_column("Variable") |>
gt() |>
fmt_number(decimals = 2) |>
sub_missing(missing_text = "") |>
tab_header(title = "Table 3", subtitle = "Correlation Matrix")
Erwartet: Eine Korrelationsmatrix mit unterem Dreieck als gt-Tabelle mit ausgeblendetem oberen Dreieck, zwei Dezimalstellen und einer klaren Ueberschrift.
Bei Fehler: Wenn sub_missing() das obere Dreieck nicht ausblendet, ueberpruefen, ob NA-Werte korrekt mit cor_matrix[upper.tri(cor_matrix)] <- NA gesetzt wurden. Wenn Variablen nicht-numerisch sind, wird cor() fehlschlagen; zuerst auf numerische Spalten filtern.
Schritt 5: ANOVA-Tabelle
aov_result <- aov(score ~ group * condition, data = data)
library(gtsummary)
tbl_anova <- broom::tidy(aov_result) |>
gt() |>
fmt_number(columns = c(sumsq, meansq, statistic), decimals = 2) |>
fmt_number(columns = p.value, decimals = 3) |>
cols_label(
term = "Source",
df = md("*df*"),
sumsq = md("*SS*"),
meansq = md("*MS*"),
statistic = md("*F*"),
p.value = md("*p*")
) |>
tab_header(title = "Table 4", subtitle = "ANOVA Results")
Erwartet: Eine formatierte ANOVA-Tabelle mit Quelle, df, SS, MS, F und p-Spalten. Interaktionsterme sind klar beschriftet und p-Werte auf drei Dezimalstellen formatiert.
Bei Fehler: Wenn broom::tidy(aov_result) unerwartete Spalten liefert, sicherstellen, dass das Modell ein aov-Objekt ist. Fuer Typ-III-Quadratsummen car::Anova(model, type = 3) statt Basis-aov() verwenden.
Schritt 6: Tabellen speichern
# Save as HTML
gtsave(my_table, "table1.html")
# Save as Word
gtsave(my_table, "table1.docx")
# Save as PNG image
gtsave(my_table, "table1.png")
# For LaTeX/PDF (kableExtra)
kableExtra::save_kable(kable_table, "table1.pdf")
Erwartet: Tabelle im angegebenen Dateiformat gespeichert (HTML, Word, PNG oder PDF). Die Ausgabedatei oeffnet sich korrekt in der entsprechenden Anwendung.
Bei Fehler: Wenn gtsave() fuer das Word-Format fehlschlaegt, sicherstellen, dass das webshot2-Paket installiert ist. Fuer PDF-Ausgabe ueber kableExtra sicherstellen, dass eine LaTeX-Distribution (TinyTeX oder MiKTeX) installiert ist.
Schritt 7: In Quarto-Dokument einbetten
```{r}
#| label: tbl-descriptives
#| tbl-cap: "Descriptive Statistics by Group"
gt(descriptives) |>
fmt_number(columns = c(M, SD), decimals = 2)
```
See @tbl-descriptives for summary statistics.
Erwartet: Die Tabelle wird inline im Quarto-Dokument mit einem querverweis-faehigen Label (@tbl-*) und einer korrekten Ueberschrift gerendert. Die Tabelle passt sich automatisch an das Ausgabeformat des Dokuments an.
Bei Fehler: Wenn die Tabelle nicht gerendert wird, ueberpruefen, ob das Chunk-Label fuer Quarto-Querverweise mit tbl- beginnt. Wenn die Formatierung in PDF verloren geht, von gt auf kableExtra fuer LaTeX-basierte Ausgabe wechseln.
Validierung
- Tabelle rendert korrekt im Zielformat (HTML, PDF, Word)
- Zahlen sind konsistent formatiert (Dezimalstellen, Ausrichtung)
- Statistische Notation folgt der Stilrichtlinie (kursiv, korrekte Symbole)
- Tabelle hat eine klare Ueberschrift und Nummerierung
- Spaltenkoepfe sind aussagekraeftig
- Anmerkungen/Fussnoten erklaeren Abkuerzungen oder Signifikanzmarker
Haeufige Fehler
- gt in PDF: gt hat eingeschraenkte PDF-Unterstuetzung. kableExtra fuer LaTeX-lastige Dokumente verwenden.
- Rundungsinkonsistenz: Immer
fmt_number()(gt) oderformat()stattround()fuer die Anzeige verwenden - Anzeige fehlender Werte: Mit
sub_missing()in gt oderoptions(knitr.kable.NA = "")konfigurieren - Breite Tabellen in PDF: Tabellen, die die Seitenbreite ueberschreiten, benoetigen
landscape()oder Schriftgroessenreduzierung - APA-Zahlenformatierung: Keine fuehrende Null fuer Werte, die durch 1 begrenzt sind (p-Werte, Korrelationen): ".03" nicht "0.03"
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