nf-core_mcp
nf-coreパイプラインを管理するためのMCPサーバー. nf-core_mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by wjlim. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 5 tools, including list-pipelines, get-pipeline-modules, search-pipelines, pipeline-config and pipeline-workflow, that an agent can call directly. It is categorized under Tool/Server and DevOps/Workflow.
このMCPについて
このMCPサーバーはnf-coreパイプラインリポジトリを管理・ナビゲートするために設計されており、パイプライン設定やワークフローをリスト表示、検索、アクセスするツールを提供します。
使用方法
npmまたはDocker経由でインストールし、nf-coreリポジトリをワークスペースにクローンした後、list-pipelines、get-pipeline-modules、search-pipelinesなどのコマンドを使用してパイプラインとやり取りします。
用途
nf-coreパイプラインの管理を効率化し、設定ファイルやワークフロー、モジュールへの簡単なアクセスを可能にするとともに、パイプラインファイル全体の検索を容易にします。
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the nf-core_mcp MCP server?
nf-core_mcp is a Model Context Protocol server from wjlim. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect nf-core_mcp to my AI client?
Add nf-core_mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does nf-core_mcp provide?
nf-core_mcp provides 5 tools: list-pipelines, get-pipeline-modules, search-pipelines, pipeline-config and pipeline-workflow.
Is nf-core_mcp free to use?
nf-core_mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
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