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add-rcpp-integration

pjt222
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メタtesting

について

このスキルは、RパッケージにRcppまたはRcppArmadilloの統合機能を追加し、計算集約的なタスクに対して高性能なC++コードを可能にします。開発者に対して、セットアップ、C++関数の記述、RcppExportsの生成、コンパイル済みコードのテストまでの手順を案内します。R関数のプロファイリングでボトルネックが発見された場合、既存のC/C++ライブラリとのインターフェースが必要な場合、またはループや線形代数のようなコンパイルによる恩恵を受けるアルゴリズムを実装する際にご利用ください。

クイックインストール

Claude Code

推奨
メイン
npx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code
プラグインコマンド代替
/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanac
Git クローン代替
git clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/add-rcpp-integration

このコマンドをClaude Codeにコピー&ペーストしてスキルをインストールします

ドキュメント

接 Rcpp

入 C++ 於 R 包以速關行。

  • R 函慢、剖證瓶→用
  • 接既有 C/C++ 庫→用
  • 算(環、遞)益於編→用
  • 增 RcppArmadillo 為線代→用

  • :既存 R 包
  • :欲代或補之 R 函
  • :欲接之外 C++ 庫
  • :用 RcppArmadillo 否(默純 Rcpp)

一:設 Rcpp 基

usethis::use_rcpp()

此:

  • src/
  • Rcpp 於 LinkingTo 與 Imports
  • R/packagename-package.R@useDynLib@importFrom Rcpp sourceCpp
  • .gitignore 避編檔

RcppArmadillo:

usethis::use_rcpp_armadillo()

得:src/ 已建,DESCRIPTION 含 Rcpp 於 LinkingTo 與 Imports,R/packagename-package.R@useDynLib

敗:usethis::use_rcpp() 敗→手建 src/、入 LinkingTo: RcppImports: Rcpp 於 DESCRIPTION,入 #' @useDynLib packagename, .registration = TRUE#' @importFrom Rcpp sourceCpp 於包級文。

二:書 C++ 函

src/my_function.cpp

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

//' Compute cumulative sum efficiently
//'
//' @param x A numeric vector
//' @return A numeric vector of cumulative sums
//' @export
// [[Rcpp::export]]
NumericVector cumsum_cpp(NumericVector x) {
  int n = x.size();
  NumericVector out(n);
  out[0] = x[0];
  for (int i = 1; i < n; i++) {
    out[i] = out[i - 1] + x[i];
  }
  return out;
}

RcppArmadillo:

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

//' Matrix multiplication using Armadillo
//'
//' @param A A numeric matrix
//' @param B A numeric matrix
//' @return The matrix product A * B
//' @export
// [[Rcpp::export]]
arma::mat mat_mult(const arma::mat& A, const arma::mat& B) {
  return A * B;
}

得:C++ 源於 src/my_function.cpp,含有效 // [[Rcpp::export]]//' 註。

敗:驗檔用 #include <Rcpp.h>(Armadillo 用 <RcppArmadillo.h>),出註於函簽前獨行,返型映 Rcpp 有效型。

三:生 RcppExports

Rcpp::compileAttributes()
devtools::document()

得:R/RcppExports.Rsrc/RcppExports.cpp 自生。

敗:察 C++ 語誤。確 // [[Rcpp::export]] 標於各出函上。

四:驗編

devtools::load_all()

得:包編、載而無誤。

敗:察編出。常症:缺系頭→裝開發庫;語誤→C++ 編訊指行;缺 Rcpp::depends 屬於 RcppArmadillo。

五:書測編

test_that("cumsum_cpp matches base R", {
  x <- c(1, 2, 3, 4, 5)
  expect_equal(cumsum_cpp(x), cumsum(x))
})

test_that("cumsum_cpp handles edge cases", {
  expect_equal(cumsum_cpp(numeric(0)), numeric(0))
  expect_equal(cumsum_cpp(c(NA_real_, 1)), c(NA_real_, NA_real_))
})

得:測過,證 C++ 函果同 R 等且妥處邊例(空向、NA)。

敗:NA 測敗→於 C++ 加 NumericVector::is_na() 之檢。空入測敗→於函首加零長守。

六:增清腳

src/Makevars

PKG_CXXFLAGS = -O2

cleanup 於包根(為 CRAN):

#!/bin/sh
rm -f src/*.o src/*.so src/*.dll

可行:chmod +x cleanup

得:src/Makevars 設編旗,cleanup 去編對。皆於包根。

敗:驗 cleanup 有可行權(chmod +x cleanup),Makevars 用製表(非空)若加 Makefile 規。

七:更 .Rbuildignore

確編產妥處:

^src/.*\.o$
^src/.*\.so$
^src/.*\.dll$

得:.Rbuildignore 紋阻編對檔入包包,存源檔與 Makevars。

敗:行 devtools::check() 察 NOTE 關 src/ 中意外檔。調紋唯排 .o.so.dll

  • devtools::load_all() 編無警
  • 編函出正果
  • 邊例(NA、空、巨)測過
  • R CMD check 過無編警
  • RcppExports 已生且提
  • 性能改以基準證

  • compileAttributes():改 C++ 後須重生 RcppExports
  • 整溢:大數用 doubleint
  • 記理:Rcpp 自理 Rcpp 型;勿手 delete
  • NA 處:C++ 不知 R 之 NA。用 Rcpp::NumericVector::is_na()
  • 跨台:避台專 C++ 特。測於 Windows、macOS、Linux
  • @useDynLib:包級文須含 @useDynLib packagename, .registration = TRUE

  • create-r-package — 增 Rcpp 前包設
  • write-testthat-tests — 測編函
  • setup-github-actions-ci — CI 須有 C++ 工
  • submit-to-cran — 編包需 CRAN 加察

GitHub リポジトリ

pjt222/agent-almanac
パス: i18n/wenyan-ultra/skills/add-rcpp-integration
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agentsagentskillsai-assisted-developmentclaude-codeskillsteams

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