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pydeseq2

K-Dense-AI
更新日 28 days ago
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テストtesting

について

PyDESeq2は、バルクRNA-seqカウントデータに対して、DESeq2の統計手法をPythonで実装した遺伝子発現差動解析を行います。単一または複数の因子からなる実験デザインに対応し、Wald検定、FDR補正、およびオプションでapeGLM shrinkageによる対数倍率変化の縮小処理を提供します。このスキルを使用して、完全なRNA-seq解析ワークフローを実行したり、RベースのDESeq2パイプラインをPythonに変換したりできます。

クイックインストール

Claude Code

推奨
メイン
npx skills add K-Dense-AI/claude-scientific-skills -a claude-code
プラグインコマンド代替
/plugin add https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills
Git クローン代替
git clone https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills.git ~/.claude/skills/pydeseq2

このコマンドをClaude Codeにコピー&ペーストしてスキルをインストールします

GitHub リポジトリ

K-Dense-AI/claude-scientific-skills
パス: scientific-skills/pydeseq2
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agent-skillsai-scientistbioinformaticschemoinformaticsclaudeclaude-skills

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