synapse-mcp
OAuth2를 통해 생의학 데이터에 접근하기 위한 Synapse MCP 서버. synapse-mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by susheel. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 7 tools, including authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table, that an agent can call directly. It is categorized under Data/Storage and Tool/Server.
이 MCP는 무엇인가
이것은 OAuth2 인증을 지원하는 Model Context Protocol 서버로, Synapse의 생의학 데이터 엔티티(데이터셋, 프로젝트, 파일) 및 해당 주석에 대한 RESTful API 접근을 제공합니다.
이 MCP 사용 방법
이 서버는 pip 또는 Docker를 통해 설치할 수 있으며, 로컬에서 실행하거나 Fly.io와 같은 클라우드 서비스에 배포할 수 있습니다. Synapse 데이터 쿼리를 위한 CLI 및 API 엔드포인트를 제공하며, 직접 인증과 OAuth2 흐름을 모두 지원합니다.
이 MCP의 용도
Synapse MCP 서버는 Synapse에 저장된 생의학 연구 데이터에 대한 프로그램적 접근을 가능하게 하며, Croissant과 같은 다양한 형식으로 데이터셋, 테이블 및 메타데이터를 쿼리할 수 있습니다. Claude와 같은 AI 도구와의 통합을 용이하게 하여 생의학 데이터 분석을 지원합니다.
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the synapse-mcp MCP server?
synapse-mcp is a Model Context Protocol server from susheel. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect synapse-mcp to my AI client?
Add synapse-mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does synapse-mcp provide?
synapse-mcp provides 7 tools: authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table.
Is synapse-mcp free to use?
synapse-mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
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