synapse-mcp
Сервер Synapse MCP для доступа к биомедицинским данным с использованием OAuth2. synapse-mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by susheel. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 7 tools, including authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table, that an agent can call directly. It is categorized under Data/Storage and Tool/Server.
Что это за MCP
Это сервер Model Context Protocol, который предоставляет RESTful API доступ к биомедицинским данным Synapse (наборам данных, проектам, файлам) и их аннотациям с поддержкой аутентификации OAuth2.
Как использовать этот MCP
Сервер можно установить через pip или Docker, затем запустить локально или развернуть в облачных сервисах, таких как Fly.io. Он предоставляет CLI и API-эндпоинты для запросов данных Synapse и поддерживает как прямую аутентификацию, так и OAuth2.
Для чего можно использовать этот MCP
Сервер Synapse MCP обеспечивает программный доступ к биомедицинским исследовательским данным, хранящимся в Synapse, включая запросы к наборам данных, таблицам и метаданным в различных форматах, таких как Croissant. Он упрощает интеграцию с инструментами ИИ, такими как Claude, для анализа биомедицинских данных.
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the synapse-mcp MCP server?
synapse-mcp is a Model Context Protocol server from susheel. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect synapse-mcp to my AI client?
Add synapse-mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does synapse-mcp provide?
synapse-mcp provides 7 tools: authenticate, get_oauth_url, get_entity, get_entity_annotations, get_entity_children, query_entities and query_table.
Is synapse-mcp free to use?
synapse-mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
Vernclaw Plugins for OpenClaw
Ready-to-use connectors for SEO data, social reading & content generation. Pay-as-you-go credits with audit logs.