nf-core_mcp
MCP сервер для управления nf-core pipelines. nf-core_mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by wjlim. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 5 tools, including list-pipelines, get-pipeline-modules, search-pipelines, pipeline-config and pipeline-workflow, that an agent can call directly. It is categorized under Tool/Server and DevOps/Workflow.
Что такое MCP
Этот MCP сервер предназначен для управления и навигации по репозиториям nf-core pipelines. Он предоставляет инструменты для просмотра, поиска и доступа к конфигурациям и рабочим процессам pipelines.
Как использовать MCP
Установите через npm или Docker, клонируйте репозитории nf-core в рабочую область и используйте команды, такие какlist-pipelines, get-pipeline-modules и search-pipelines, для взаимодействия с pipelines.
Для чего можно использовать MCP
Он может быть использован для упрощения управления nf-core pipelines, обеспечивая легкий доступ к конфигурациям, рабочим процессам и модулям, а также облегчая поиск по файлам pipelines.
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the nf-core_mcp MCP server?
nf-core_mcp is a Model Context Protocol server from wjlim. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect nf-core_mcp to my AI client?
Add nf-core_mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does nf-core_mcp provide?
nf-core_mcp provides 5 tools: list-pipelines, get-pipeline-modules, search-pipelines, pipeline-config and pipeline-workflow.
Is nf-core_mcp free to use?
nf-core_mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
Vernclaw Plugins for OpenClaw
Ready-to-use connectors for SEO data, social reading & content generation. Pay-as-you-go credits with audit logs.