samtools_mcp

Что это за MCP

Данный MCP предоставляет стандартизированный интерфейс для работы с файлами геномных выравниваний SAM/BAM/CRAM, предлагая возможности конвертации форматов, сортировки, индексации и статистического анализа.

Как использовать этот MCP

MCP можно использовать через Docker (рекомендуется) или локальную установку. Он предоставляет Python-методы для стандартных операций, таких как view, sort, index и расчет depth для файлов выравниваний.

Для чего можно использовать этот MCP

Этот MCP позволяет исследователям в области геномики программно обрабатывать файлы выравниваний, включая конвертацию форматов, анализ конкретных регионов, фильтрацию чтений и генерацию комплексной статистики для файлов SAM/BAM/CRAM.