MCP HubMCP Hub
Вернуться к навыкам

pydeseq2

drshailesh88
Обновлено 5 days ago
6 просмотров
2
2
Посмотреть на GitHub
Тестированиеtesting

О программе

PyDESeq2 позволяет проводить анализ дифференциальной экспрессии генов для данных bulk RNA-seq непосредственно в Python, реализуя рабочие процессы DESeq2. Он идентифицирует дифференциально экспрессируемые гены с помощью тестов Вальда с поправкой на FDR, поддерживает однофакторные и многофакторные схемы эксперимента и создаёт визуализации. Используйте его для анализа подсчётов RNA-seq, учёта ковариат, таких как эффекты партий, и интеграции DESeq2 в Python-конвейеры.

Быстрая установка

Claude Code

Рекомендуется
Основной
npx skills add drshailesh88/integrated_content_OS -a claude-code
Команда плагинаАльтернативный
/plugin add https://github.com/drshailesh88/integrated_content_OS
Git клонированиеАльтернативный
git clone https://github.com/drshailesh88/integrated_content_OS.git ~/.claude/skills/pydeseq2

Скопируйте и вставьте эту команду в Claude Code для установки этого навыка

GitHub репозиторий

drshailesh88/integrated_content_OS
Путь: skills/scientific/pydeseq2
0

Похожие навыки

evaluating-llms-harness

Тестирование

Этот навык Claude запускает lm-evaluation-harness для тестирования LLM на более чем 60 стандартизированных академических задачах, таких как MMLU и GSM8K. Он предназначен для разработчиков, чтобы сравнивать качество моделей, отслеживать прогресс обучения или сообщать академические результаты. Инструмент поддерживает различные бэкенды, включая модели HuggingFace и vLLM.

Просмотреть навык

cloudflare-cron-triggers

Тестирование

Этот навык предоставляет обширные знания по реализации Cloudflare Cron Triggers для планирования запуска Workers с помощью cron-выражений. Он охватывает настройку периодических задач, заданий технического обслуживания и автоматизированных рабочих процессов, а также решение распространенных проблем, таких как неверные cron-выражения и ошибки часовых поясов. Разработчики могут использовать его для настройки планировщиков обработчиков, тестирования cron-триггеров и интеграции с Workflows и Green Compute.

Просмотреть навык

webapp-testing

Тестирование

Этот навык Claude предоставляет инструментарий на базе Playwright для тестирования локальных веб-приложений с помощью Python-скриптов. Он позволяет проводить проверку фронтенда, отладку интерфейса, создание скриншотов и просмотр логов, одновременно управляя жизненным циклом сервера. Используйте его для задач автоматизации браузера, но запускайте скрипты напрямую, вместо чтения их исходного кода, чтобы избежать загрязнения контекста.

Просмотреть навык

finishing-a-development-branch

Тестирование

Этот навык помогает разработчикам завершать готовую работу, проверяя прохождение тестов и предлагая структурированные варианты интеграции. Он направляет рабочий процесс по слиянию, созданию пул-реквестов или очистке веток после завершения реализации. Используйте его, когда ваш код готов и протестирован, чтобы систематически завершать процесс разработки.

Просмотреть навык