MCP HubMCP Hub
Вернуться к навыкам

ginkgo-cloud-lab

K-Dense-AI
Обновлено Today
26,534
2,743
26,534
Посмотреть на GitHub
Метаautomation

О программе

Этот навык Claude позволяет разработчикам отправлять и управлять биологическими протоколами в Cloud Lab компании Ginkgo Bioworks для автономного выполнения лабораторных работ. Он поддерживает специфические рабочие процессы, такие как бесклеточная экспрессия белка и генерация флуоресцентного пиксельного искусства, обеспечивая выбор протокола, подготовку входных данных и оформление заказов. Используйте его при создании интеграций, требующих удаленного доступа к автоматизированной лабораторной инфраструктуре и сервисам Ginkgo.

Быстрая установка

Claude Code

Рекомендуется
Основной
npx skills add K-Dense-AI/claude-scientific-skills -a claude-code
Команда плагинаАльтернативный
/plugin add https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills
Git клонированиеАльтернативный
git clone https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills.git ~/.claude/skills/ginkgo-cloud-lab

Скопируйте и вставьте эту команду в Claude Code для установки этого навыка

Документация

Ginkgo Cloud Lab

Overview

Ginkgo Cloud Lab (https://cloud.ginkgo.bio) provides remote access to Ginkgo Bioworks' autonomous lab infrastructure. Protocols are executed on Reconfigurable Automation Carts (RACs) -- modular units with robotic arms, maglev sample transport, and industrial-grade software spanning 70+ instruments.

The platform also includes EstiMate, an AI agent that accepts human-language protocol descriptions and returns feasibility assessments and pricing for custom workflows beyond the listed protocols.

Available Protocols

1. Cell Free Protein Expression Validation

Rapid go/no-go expression screening using reconstituted E. coli CFPS. Submit a FASTA sequence (up to 1800 bp) and receive expression confirmation, baseline titer (mg/L), and initial purity with virtual gel images.

2. Cell Free Protein Expression Optimization

DoE-based optimization across up to 24 conditions per protein (lysates, temperatures, chaperones, disulfide enhancers, cofactors). Designed for difficult-to-express and membrane proteins.

3. Fluorescent Pixel Art Generation

Transform a pixel art image (48x48 to 96x96 px, PNG/SVG) into fluorescent bacterial artwork using up to 11 E. coli strains via acoustic dispensing. Delivered as high-res UV photographs.

General Ordering Workflow

  1. Select a protocol at https://cloud.ginkgo.bio/protocols
  2. Configure parameters (number of samples/proteins, replicates, plates)
  3. Upload input files (FASTA for protein protocols, PNG/SVG for pixel art)
  4. Add any special requirements in the Additional Details field
  5. Submit and receive a feasibility report and price quote

For protocols not listed above, use the EstiMate chat to describe a custom protocol in plain language and receive compatibility assessment and pricing.

Authentication

Access Ginkgo Cloud Lab at https://cloud.ginkgo.bio. Account creation or institutional access may be required. Contact Ginkgo at [email protected] for access questions.

Key Infrastructure

  • RACs (Reconfigurable Automation Carts): Modular robotic units with high-precision arms and maglev transport
  • Catalyst Software: Protocol orchestration, scheduling, parameterization, and real-time monitoring
  • 70+ integrated instruments: Sample prep, liquid handling, analytical readouts, storage, incubation
  • Nebula: Ginkgo's autonomous lab facility in Boston, MA

GitHub репозиторий

K-Dense-AI/claude-scientific-skills
Путь: skills/ginkgo-cloud-lab
0
agent-skillsai-scientistbioinformaticschemoinformaticsclaudeclaude-skills

Похожие навыки

content-collections

Мета

Этот навык предоставляет проверенную в продакшене настройку для Content Collections — TypeScript-ориентированного инструмента, который преобразует файлы Markdown/MDX в типобезопасные коллекции данных с валидацией Zod. Используйте его при создании блогов, сайтов документации или контентных приложений на Vite + React для обеспечения типобезопасности и автоматической проверки содержимого. Он охватывает всё: от настройки плагина Vite и компиляции MDX до оптимизации развертывания и валидации схем.

Просмотреть навык

polymarket

Мета

Этот навык позволяет разработчикам создавать приложения на платформе прогнозных рынков Polymarket, включая интеграцию с API для торговли и получения рыночных данных. Он также обеспечивает потоковую передачу данных в реальном времени через WebSocket для отслеживания текущих сделок и рыночной активности. Используйте его для реализации торговых стратегий или создания инструментов, обрабатывающих обновления рынка в реальном времени.

Просмотреть навык

creating-opencode-plugins

Мета

Этот навык помогает разработчикам создавать плагины OpenCode, которые подключаются к более чем 25 типам событий, таким как команды, файлы и операции LSP. Он предоставляет структуру плагина, спецификации API событий и шаблоны реализации для модулей на JavaScript/TypeScript. Используйте его, когда вам нужно перехватывать, отслеживать или расширять жизненный цикл ассистента OpenCode AI с помощью пользовательской событийно-ориентированной логики.

Просмотреть навык

sglang

Мета

SGLang — это высокопроизводительный фреймворк для обслуживания больших языковых моделей (LLM), специализирующийся на быстрой структурированной генерации JSON, regex и рабочих процессов агентов с использованием кэширования префиксов RadixAttention. Он обеспечивает значительно более высокую скорость вывода, особенно для задач с повторяющимися префиксами, что делает его идеальным для сложных структурированных результатов и многократных диалогов. Выбирайте SGLang вместо альтернатив, таких как vLLM, когда вам требуется ограниченное декодирование или вы создаете приложения с интенсивным совместным использованием префиксов.

Просмотреть навык