MCP HubMCP Hub
Вернуться к навыкам

bio-ecological-genomics-edna-metabarcoding

GPTomics
Обновлено 4 days ago
2 просмотров
312
51
312
Посмотреть на GitHub
Разработкаaidata

О программе

Этот навык обрабатывает данные метабаркодирования экологической ДНК, преобразуя сырые ампликонные чтения в таблицы встречаемости видов с использованием OBITools3 и DADA2 для удаления праймеров, шумоподавления и детекции химер. Он поддерживает несколько баркодных регионов (COI, 12S, rbcL, ITS) и таксономические базы данных, а также включает фильтрацию контаминации и моделирование встречаемости для коррекции вероятности детекции. Используйте его для мониторинга биоразнообразия по эДНК из воды, почвы или сборных образцов, но не для анализа микробиома человека по 16S.

Быстрая установка

Claude Code

Рекомендуется
Основной
npx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code
Команда плагинаАльтернативный
/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkills
Git клонированиеАльтернативный
git clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-ecological-genomics-edna-metabarcoding

Скопируйте и вставьте эту команду в Claude Code для установки этого навыка

GitHub репозиторий

GPTomics/bioSkills
Путь: ecological-genomics/edna-metabarcoding
0

Похожие навыки

qmd

Разработка

qmd — это локальный инструмент командной строки для поиска и индексирования, который позволяет разработчикам индексировать и осуществлять поиск по локальным файлам с использованием гибридного поиска, сочетающего BM25, векторные эмбеддинги и реранкинг. Он поддерживает как использование через командную строку, так и режим MCP (Model Context Protocol) для интеграции с Claude. Инструмент использует Ollama для создания эмбеддингов и хранит индексы локально, что делает его идеальным для поиска по документации или кодовой базе прямо из терминала.

Просмотреть навык

subagent-driven-development

Разработка

Этот навык выполняет планы реализации, создавая нового суб-агента для каждой независимой задачи, проводя проверку кода между задачами. Он позволяет быстро итерировать, сохраняя контроль качества через этот процесс ревью. Используйте его при работе в основном с независимыми задачами в рамках одной сессии, чтобы обеспечить непрерывный прогресс со встроенными проверками качества.

Просмотреть навык

mcporter

Разработка

Навык mcporter позволяет разработчикам управлять и вызывать серверы Model Context Protocol (MCP) напрямую из Claude. Он предоставляет команды для вывода списка доступных серверов, вызова их инструментов с аргументами, а также для обработки аутентификации и управления жизненным циклом демона. Используйте этот навык для интеграции и тестирования функциональности серверов MCP в вашем рабочем процессе разработки.

Просмотреть навык

adk-deployment-specialist

Разработка

Этот навык развертывает и оркестрирует агентов Vertex AI ADK с использованием протокола A2A, управляя обнаружением AgentCard, отправкой задач и поддерживая инструменты, такие как песочница для выполнения кода и Memory Bank. Он позволяет создавать мультиагентные системы с последовательными, параллельными или циклическими схемами оркестрации на Python, Java или Go. Используйте его, когда требуется развернуть агентов ADK или оркестрировать рабочие процессы агентов в Google Cloud.

Просмотреть навык