bio-workflows-microbiome-pipeline
À propos
Cette compétence fournit un pipeline d'analyse d'amplicons 16S/ITS de bout en bout, traitant les lectures FASTQ via l'inférence d'ASV avec DADA2, l'attribution taxonomique, l'analyse de diversité et les tests d'abondance différentielle avec ALDEx2. Elle orchestre plusieurs outils spécifiques au microbiome en un flux de travail complet pour les développeurs. Utilisez-la lorsque vous avez besoin d'une analyse standardisée et reproductible pour les données de séquençage de microbiome, des lectures brutes aux résultats statistiques.
Installation rapide
Claude Code
Recommandénpx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkillsgit clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-workflows-microbiome-pipelineCopiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence
Dépôt GitHub
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