bio-workflows-microbiome-pipeline
À propos
Cette compétence fournit un pipeline d'analyse d'amplicons 16S/ITS de bout en bout, traitant les lectures FASTQ via l'inférence d'ASV avec DADA2, l'attribution taxonomique, l'analyse de diversité et les tests d'abondance différentielle avec ALDEx2. Elle orchestre plusieurs outils spécifiques au microbiome en un flux de travail complet pour les développeurs. Utilisez-la lorsque vous avez besoin d'une analyse standardisée et reproductible pour les données de séquençage de microbiome, des lectures brutes aux résultats statistiques.
Installation rapide
Claude Code
Recommandénpx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkillsgit clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-workflows-microbiome-pipelineCopiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence
Dépôt GitHub
Frequently asked questions
What is the bio-workflows-microbiome-pipeline skill?
bio-workflows-microbiome-pipeline is a Claude Skill by GPTomics. Skills package instructions and resources that Claude loads on demand, so Claude can perform bio-workflows-microbiome-pipeline-related tasks without extra prompting.
How do I install bio-workflows-microbiome-pipeline?
Use the install commands on this page: add bio-workflows-microbiome-pipeline to Claude Code as a plugin, or clone its repository into your skills directory, then restart Claude so it picks up the skill.
What category does bio-workflows-microbiome-pipeline belong to?
bio-workflows-microbiome-pipeline is in the Testing category, tagged testing, automation and data.
Is bio-workflows-microbiome-pipeline free to use?
Yes. bio-workflows-microbiome-pipeline is listed on AIMCP and free to install. It runs inside Claude, so no separate service account is required to use the skill itself.
Compétences associées
Cette compétence Claude exécute le lm-evaluation-harness pour évaluer les modèles de langage sur plus de 60 tâches académiques standardisées telles que MMLU et GSM8K. Elle est conçue pour permettre aux développeurs de comparer la qualité des modèles, de suivre les progrès de l'entraînement ou de rapporter des résultats académiques. L'outil prend en charge différents backends, incluant les modèles HuggingFace et vLLM.
Cette compétence fournit une connaissance complète pour la mise en œuvre de Déclencheurs Cron Cloudflare afin de planifier des Workers à l'aide d'expressions cron. Elle couvre la configuration de tâches périodiques, de travaux de maintenance et de flux de travail automatisés, tout en traitant des problèmes courants tels que les expressions cron non valides et les problèmes de fuseau horaire. Les développeurs peuvent l'utiliser pour configurer des gestionnaires planifiés, tester des déclencheurs cron et intégrer avec Workflows et Green Compute.
Cette Compétence Claude fournit une boîte à outils basée sur Playwright pour tester des applications web locales via des scripts Python. Elle permet la vérification frontend, le débogage d'interface utilisateur, la capture d'écrans et la consultation des journaux, tout en gérant les cycles de vie du serveur. Utilisez-la pour les tâches d'automatisation de navigateur, mais exécutez les scripts directement plutôt que de lire leur code source pour éviter la pollution du contexte.
Cette compétence aide les développeurs à finaliser leur travail en vérifiant que les tests passent, puis en présentant des options d'intégration structurées. Elle guide le processus de fusion, de création de PRs ou de nettoyage des branches une fois l'implémentation terminée. Utilisez-la lorsque votre code est prêt et testé pour finaliser systématiquement le cycle de développement.
