bio-duplicate-handling
À propos
Cette compétence marque et supprime les duplicats PCR/optiques des fichiers BAM en utilisant samtools fixmate et markdup. Elle est essentielle pour préparer les alignements en vue de l'appel de variants ou lorsque les lectures dupliquées biaiseraient les analyses en aval. La mise en œuvre propose à la fois des approches en ligne de commande (CLI) et en Python (pysam), accompagnées de conseils sur la compatibilité des versions.
Installation rapide
Claude Code
Recommandénpx skills add GPTomics/bioSkills -a claude-code/plugin add https://github.com/GPTomics/bioSkillsgit clone https://github.com/GPTomics/bioSkills.git ~/.claude/skills/bio-duplicate-handlingCopiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence
Dépôt GitHub
Frequently asked questions
What is the bio-duplicate-handling skill?
bio-duplicate-handling is a Claude Skill by GPTomics. Skills package instructions and resources that Claude loads on demand, so Claude can perform bio-duplicate-handling-related tasks without extra prompting.
How do I install bio-duplicate-handling?
Use the install commands on this page: add bio-duplicate-handling to Claude Code as a plugin, or clone its repository into your skills directory, then restart Claude so it picks up the skill.
What category does bio-duplicate-handling belong to?
bio-duplicate-handling is in the Other category, tagged general.
Is bio-duplicate-handling free to use?
Yes. bio-duplicate-handling is listed on AIMCP and free to install. It runs inside Claude, so no separate service account is required to use the skill itself.
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