書 roxygen 文

立全 roxygen2 文於 R 包之函、數、類。

用時

• 加文於新出之函
• 錄內助函
• 錄包之數
• 錄 S3/S4/R6 類與法
• 修文相關之 R CMD check 注

入

• 必要：欲錄之 R 函、數、或類
• 可選：相關函以互引（@family、@seealso）
• 可選：函是否宜出

法

第一步：書函之文

置 roxygen 注於函之上：

#' Compute the weighted mean of a numeric vector
#'
#' Calculates the arithmetic mean of `x` weighted by `w`. Missing values
#' in either `x` or `w` are handled according to the `na.rm` parameter.
#'
#' @param x A numeric vector of values.
#' @param w A numeric vector of weights, same length as `x`.
#' @param na.rm Logical. Should missing values be removed? Default `FALSE`.
#'
#' @return A single numeric value representing the weighted mean.
#'
#' @examples
#' weighted_mean(1:5, rep(1, 5))
#' weighted_mean(c(1, 2, NA, 4), c(1, 1, 1, 1), na.rm = TRUE)
#'
#' @export
#' @family summary functions
#' @seealso [stats::weighted.mean()] for the base R equivalent
weighted_mean <- function(x, w, na.rm = FALSE) {
  # implementation
}

得：全 roxygen 塊含題、述、各參之 @param、@return、@examples、與 @export。

敗則：標不確者，察 ?roxygen2::rd_roclet。常忽 @return，CRAN 為諸出函所必。

第二步：要標參

得：諸函類所需標皆識。出函至少含 @param、@return、@examples、與 @export。

敗則：標陌者，查 roxygen2 之文 為用與語法。

第三步：錄數

立 R/data.R：

#' Example dataset of city temperatures
#'
#' A dataset containing daily temperature readings for major cities.
#'
#' @format A data frame with 365 rows and 4 variables:
#' \describe{
#'   \item{date}{Date of observation}
#'   \item{city}{City name}
#'   \item{temp_c}{Temperature in Celsius}
#'   \item{humidity}{Relative humidity percentage}
#' }
#' @source \url{https://example.com/data}
"city_temperatures"

得：R/data.R 含每數之 roxygen 塊，附 @format 述結構與 @source 供數源。

敗則：R/CMD check 警未錄之數者，確引串（如 "city_temperatures"）精配 usethis::use_data() 所存物名。

第四步：錄包

立 R/packagename-package.R：

#' @keywords internal
"_PACKAGE"

## usethis namespace: start
## usethis namespace: end
NULL

得：R/packagename-package.R 存附 @keywords internal 與 "_PACKAGE" 哨。行 devtools::document() 生 man/packagename-package.Rd。

敗則：R CMD check 報缺包文頁者，驗文名為 R/<packagename>-package.R 且含 "_PACKAGE" 串。

第五步：處特例

名含點之函（S3 法）：

#' @export
#' @rdname process
process.myclass <- function(x, ...) {
  # S3 method
}

重用文 以 @inheritParams：

#' @inheritParams weighted_mean
#' @param trim Fraction of observations to trim.
trimmed_mean <- function(x, w, na.rm = FALSE, trim = 0.1) {
  # implementation
}

「無可見綁」修 用 .data 代名：

#' @importFrom rlang .data
my_function <- function(df) {
  dplyr::filter(df, .data$column > 5)
}

得：特例（S3 法、繼參、.data 代名）正錄。@rdname 群 S3 法。@inheritParams 重用參文無重複。

敗則：R CMD check 警「無可見綁全變」者，加 #' @importFrom rlang .data 或末用 utils::globalVariables()。

第六步：生其文

devtools::document()

得：man/ 域更附每錄物之 .Rd 文。NAMESPACE 重生附正出與入。

敗則：察 roxygen 語法訛。常見：\describe{} 中括未閉、行缺 #' 首、或標名無效。修後再行 devtools::document()。

驗

• 諸出函有 @param、@return、@examples
• devtools::document() 無訛行
• devtools::check() 無文警
• @family 標正群相關函
• 例無訛行（試 devtools::run_examples()）

陷

• 缺 @return：CRAN 諸出函必錄返值
• 例需網/證：\dontrun{} 包之附注釋故
• 慢例：\donttest{} 為運而 CRAN 過久之例
• roxygen 中 markdown：DESCRIPTION 中 Roxygen: list(markdown = TRUE) 啟之
• 忘行 devtools::document()：man 頁為生，非手書

參

• create-r-package - 包初設含 roxygen 設
• write-testthat-tests - 試所錄之函
• write-vignette - 函參外之長文
• submit-to-cran - CRAN 之文要