构建 pkgdown 站点

为 R 包配置并部署 pkgdown 文档网站。

适用场景

• 为 R 包创建文档站点
• 自定义 pkgdown 布局、主题或导航
• 修复已部署 pkgdown 站点上的 404 错误
• 在不同部署方法之间迁移

输入

• 必需：带有 roxygen2 文档的 R 包
• 必需：GitHub 仓库
• 可选：自定义主题或品牌标识
• 可选：需要作为文章包含的 vignette

步骤

第 1 步：初始化 pkgdown

usethis::use_pkgdown()

这会创建 _pkgdown.yml 并将 pkgdown 添加到 .Rbuildignore。

预期结果： _pkgdown.yml 存在于项目根目录。.Rbuildignore 包含 pkgdown 相关条目。

失败处理： 使用 install.packages("pkgdown") 安装 pkgdown。如果 _pkgdown.yml 已存在，该函数将更新 .Rbuildignore 而不覆盖配置。

第 2 步：配置 _pkgdown.yml

url: https://username.github.io/packagename/

development:
  mode: release

template:
  bootstrap: 5
  bootswatch: flatly

navbar:
  structure:
    left: [intro, reference, articles, news]
    right: [search, github]
  components:
    github:
      icon: fa-github
      href: https://github.com/username/packagename

reference:
  - title: Core Functions
    desc: Primary package functionality
    contents:
      - main_function
      - helper_function
  - title: Utilities
    desc: Helper and utility functions
    contents:
      - starts_with("util_")

articles:
  - title: Getting Started
    contents:
      - getting-started
  - title: Advanced Usage
    contents:
      - advanced-features
      - customization

关键：设置 development: mode: release。默认的 mode: auto 会在 URL 后附加 /dev/，导致 GitHub Pages 上的 404 错误。

预期结果： _pkgdown.yml 包含有效的 YAML，具有适合该包的 url、template、navbar、reference 和 articles 部分。

失败处理： 使用在线 YAML 检查器验证 YAML 语法。确保 reference.contents 中的所有函数名称与实际导出的函数匹配。

第 3 步：本地构建

pkgdown::build_site()

预期结果： 创建 docs/ 目录，包含完整的站点，包括 index.html、函数参考页面和文章。

失败处理： 常见问题：缺少 pandoc（在 .Renviron 中设置 RSTUDIO_PANDOC）、缺少 vignette 依赖（安装建议的包），或示例损坏（修复或用 \dontrun{} 包裹）。

第 4 步：预览站点

pkgdown::preview_site()

验证导航、函数参考、文章和搜索功能是否正常工作。

预期结果： 站点在浏览器中以 localhost 打开。所有导航链接工作正常，函数参考页面渲染正确，搜索返回结果。

失败处理： 如果预览未打开，手动在浏览器中打开 docs/index.html。如果页面缺失，检查是否在构建站点之前运行了 devtools::document()。

第 5 步：部署到 GitHub Pages

方法 A：GitHub Actions（推荐）

参见 setup-github-actions-ci 技能获取 pkgdown 工作流。

方法 B：手动分支部署

# Build site
Rscript -e "pkgdown::build_site()"

# Create gh-pages branch if it doesn't exist
git checkout --orphan gh-pages
git rm -rf .
cp -r docs/* .
git add .
git commit -m "Deploy pkgdown site"
git push origin gh-pages

# Switch back to main
git checkout main

预期结果： gh-pages 分支存在于远程仓库中，站点文件位于根目录级别。

失败处理： 如果推送被拒绝，确保你对仓库有写入权限。如果使用 GitHub Actions 部署，跳过此步骤并遵循 setup-github-actions-ci 技能。

第 6 步：配置 GitHub Pages

1. 前往仓库 Settings > Pages
2. 将 Source 设置为"Deploy from a branch"
3. 选择 gh-pages 分支，/ (root) 文件夹
4. 保存

预期结果： 站点在几分钟内可通过 https://username.github.io/packagename/ 访问。

失败处理： 如果站点返回 404，验证 Pages 来源是否与部署方法匹配（分支部署需要"Deploy from a branch"）。检查 _pkgdown.yml 中是否设置了 development: mode: release。

第 7 步：在 DESCRIPTION 中添加 URL

URL: https://username.github.io/packagename/, https://github.com/username/packagename

预期结果： DESCRIPTION 的 URL 字段包含 pkgdown 站点 URL 和 GitHub 仓库 URL，用逗号分隔。

失败处理： 如果 R CMD check 对无效 URL 发出警告，在添加 URL 之前验证 pkgdown 站点是否已实际部署且可访问。

验证清单

• 站点在本地构建无错误
• 所有函数参考页面正确渲染
• 文章/vignette 可访问且渲染正确
• 搜索功能正常工作
• 导航链接正确
• 站点成功部署到 GitHub Pages
• 已部署站点上无 404 错误
• _pkgdown.yml 中设置了 development: mode: release

常见问题

• 部署后的 404 错误：几乎总是由 development: mode: auto（默认值）引起。更改为 mode: release

• 缺少参考页面：函数必须被导出并有文档。先运行 devtools::document()

• 损坏的 vignette 链接：在交叉引用中使用 vignette("name") 语法，而非文件路径

• Logo 不显示：将 logo 放在 man/figures/logo.png 并在 _pkgdown.yml 中引用

• 搜索不工作：需要在 _pkgdown.yml 中正确设置 url 字段

• 混合系统上错误的 R 二进制文件：在 WSL 或 Docker 上，Rscript 可能解析为跨平台包装器而非原生 R。使用 which Rscript && Rscript --version 检查。优先使用原生 R 二进制文件（例如 Linux/WSL 上的 /usr/local/bin/Rscript）以确保可靠性。有关 R 路径配置，请参阅 Setting Up Your Environment。

相关技能

• setup-github-actions-ci — 自动化 pkgdown 部署工作流
• write-roxygen-docs — 出现在站点上的函数文档
• write-vignette — 出现在站点导航中的文章
• release-package-version — 在发布时触发站点重建