write-roxygen-docs
À propos
Cette compétence Claude génère une documentation roxygen2 complète pour les packages R en suivant les directives de style Tidyverse. Elle gère les fonctions, les jeux de données, les classes et les méthodes tout en créant automatiquement les entrées NAMESPACE appropriées et les renvois internes. Utilisez-la pour ajouter la documentation de nouveaux composants de package ou pour corriger les avertissements de R CMD check liés à la documentation.
Installation rapide
Claude Code
Recommandénpx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanacgit clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/write-roxygen-docsCopiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence
Documentation
name: write-roxygen-docs description: > roxygen2-Dokumentation fuer Funktionen, Datensaetze und Klassen eines R-Pakets schreiben. Umfasst alle gaengigen Tags, Querverweise, Beispiele und die Generierung von NAMESPACE-Eintraegen. Folgt dem Tidyverse-Dokumentationsstil. Verwenden beim Hinzufuegen von Dokumentation zu neuen exportierten Funktionen, internen Hilfsfunktionen, Datensaetzen, S3/S4/R6-Klassen und -Methoden oder beim Beheben dokumentationsbezogener R CMD check-Hinweise. locale: de source_locale: en source_commit: 6f65f316 translator: claude-opus-4-6 translation_date: 2026-03-16 license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: r-packages complexity: basic language: R tags: r, roxygen2, documentation, namespace
Roxygen-Dokumentation schreiben
Vollstaendige roxygen2-Dokumentation fuer Funktionen, Datensaetze und Klassen eines R-Pakets erstellen.
Wann verwenden
- Dokumentation zu einer neuen exportierten Funktion hinzufuegen
- Interne Hilfsfunktionen dokumentieren
- Paketdatensaetze dokumentieren
- S3/S4/R6-Klassen und -Methoden dokumentieren
- Dokumentationsbezogene
R CMD check-Hinweise beheben
Eingaben
- Erforderlich: Zu dokumentierende R-Funktion, Datensatz oder Klasse
- Optional: Verwandte Funktionen fuer Querverweise (
@family,@seealso) - Optional: Ob die Funktion exportiert werden soll
Vorgehensweise
Schritt 1: Funktionsdokumentation schreiben
Roxygen-Kommentare direkt oberhalb der Funktion platzieren:
#' Compute the weighted mean of a numeric vector
#'
#' Calculates the arithmetic mean of `x` weighted by `w`. Missing values
#' in either `x` or `w` are handled according to the `na.rm` parameter.
#'
#' @param x A numeric vector of values.
#' @param w A numeric vector of weights, same length as `x`.
#' @param na.rm Logical. Should missing values be removed? Default `FALSE`.
#'
#' @return A single numeric value representing the weighted mean.
#'
#' @examples
#' weighted_mean(1:5, rep(1, 5))
#' weighted_mean(c(1, 2, NA, 4), c(1, 1, 1, 1), na.rm = TRUE)
#'
#' @export
#' @family summary functions
#' @seealso [stats::weighted.mean()] for the base R equivalent
weighted_mean <- function(x, w, na.rm = FALSE) {
# implementation
}
Erwartet: Vollstaendiger Roxygen-Block mit Titel, Beschreibung, @param fuer jeden Parameter, @return, @examples und @export.
Bei Fehler: Bei Unsicherheit ueber ein Tag ?roxygen2::rd_roclet konsultieren. Haeufig vergessen wird @return, das CRAN fuer alle exportierten Funktionen erfordert.
Schritt 2: Referenz der wesentlichen Tags
| Tag | Zweck | Fuer Export erforderlich? |
|---|---|---|
#' Title | Erste Zeile, ein Satz | Ja |
#' Description | Absatz nach Leerzeile | Ja |
@param | Parameterdokumentation | Ja |
@return | Beschreibung des Rueckgabewerts | Ja (CRAN) |
@examples | Verwendungsbeispiele | Dringend empfohlen |
@export | Zu NAMESPACE hinzufuegen | Ja, fuer oeffentliche API |
@family | Verwandte Funktionen gruppieren | Empfohlen |
@seealso | Querverweise | Optional |
@keywords internal | Als intern markieren | Fuer nicht-exportierte Dokumentation |
Erwartet: Alle erforderlichen Tags fuer den Funktionstyp sind identifiziert. Exportierte Funktionen haben mindestens @param, @return, @examples und @export.
Bei Fehler: Bei unbekannten Tags die roxygen2-Dokumentation fuer Verwendung und Syntax konsultieren.
Schritt 3: Datensaetze dokumentieren
R/data.R erstellen:
#' Example dataset of city temperatures
#'
#' A dataset containing daily temperature readings for major cities.
#'
#' @format A data frame with 365 rows and 4 variables:
#' \describe{
#' \item{date}{Date of observation}
#' \item{city}{City name}
#' \item{temp_c}{Temperature in Celsius}
#' \item{humidity}{Relative humidity percentage}
#' }
#' @source \url{https://example.com/data}
"city_temperatures"
Erwartet: R/data.R enthaelt Roxygen-Bloecke fuer jeden Datensatz mit @format zur Beschreibung der Struktur und @source zur Angabe der Datenherkunft.
Bei Fehler: Wenn R CMD check vor nicht dokumentierten Datensaetzen warnt, sicherstellen, dass der in Anfuehrungszeichen gesetzte String (z.B. "city_temperatures") genau dem Objektnamen entspricht, der mit usethis::use_data() gespeichert wurde.
Schritt 4: Das Paket dokumentieren
R/packagename-package.R erstellen:
#' @keywords internal
"_PACKAGE"
## usethis namespace: start
## usethis namespace: end
NULL
Erwartet: R/packagename-package.R existiert mit @keywords internal und dem "_PACKAGE"-Sentinel. devtools::document() generiert man/packagename-package.Rd.
Bei Fehler: Wenn R CMD check eine fehlende Paketdokumentationsseite meldet, sicherstellen, dass die Datei R/<packagename>-package.R heisst und den String "_PACKAGE" enthaelt.
Schritt 5: Sonderfaelle behandeln
Funktionen mit Punkten im Namen (S3-Methoden):
#' @export
#' @rdname process
process.myclass <- function(x, ...) {
# S3 method
}
Dokumentation wiederverwenden mit @inheritParams:
#' @inheritParams weighted_mean
#' @param trim Fraction of observations to trim.
trimmed_mean <- function(x, w, na.rm = FALSE, trim = 0.1) {
# implementation
}
Keine sichtbare Bindung beheben mit dem .data-Pronomen:
#' @importFrom rlang .data
my_function <- function(df) {
dplyr::filter(df, .data$column > 5)
}
Erwartet: Sonderfaelle (S3-Methoden, vererbte Parameter, .data-Pronomen) sind korrekt dokumentiert. @rdname gruppiert S3-Methoden zusammen. @inheritParams verwendet Parameter-Dokumentation ohne Duplikation.
Bei Fehler: Wenn R CMD check vor "no visible binding for global variable" warnt, #' @importFrom rlang .data hinzufuegen oder als letzten Ausweg utils::globalVariables() verwenden.
Schritt 6: Dokumentation generieren
devtools::document()
Erwartet: man/-Verzeichnis mit .Rd-Dateien fuer jedes dokumentierte Objekt aktualisiert. NAMESPACE mit korrekten Exporten und Importen neu generiert.
Bei Fehler: Auf Roxygen-Syntaxfehler pruefen. Haeufige Probleme: nicht geschlossene Klammern in \describe{}, fehlende #'-Praefix in einer Zeile oder ungueltiger Tag-Name. devtools::document() nach der Korrektur erneut ausfuehren.
Validierung
- Jede exportierte Funktion hat
@param,@returnund@examples -
devtools::document()laeuft ohne Fehler -
devtools::check()zeigt keine Dokumentationswarnungen -
@family-Tags gruppieren verwandte Funktionen korrekt - Beispiele laufen ohne Fehler (testen mit
devtools::run_examples())
Haeufige Stolperfallen
- Fehlendes
@return: CRAN erfordert, dass alle exportierten Funktionen ihren Rueckgabewert dokumentieren - Beispiele, die Internet/Authentifizierung benoetigen: In
\dontrun{}einschliessen mit einem erklaerenden Kommentar - Langsame Beispiele:
\donttest{}fuer Beispiele verwenden, die funktionieren, aber fuer CRAN zu lange dauern - Markdown in roxygen: Mit
Roxygen: list(markdown = TRUE)in DESCRIPTION aktivieren devtools::document()zu laufen vergessen: Man-Pages werden generiert, nicht haendisch geschrieben
Verwandte Skills
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