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ipsae

NeverSight
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Autrerankingscoringbinding

À propos

La compétence ipsae classe les conceptions de protéines liantes en utilisant la fonction de notation ipSAE, qui surpasse ipTM et iPAE pour identifier les liants efficaces. Utilisez-la pour filtrer et classer les résultats d'outils comme RFdiffusion ou pour comparer les prédictions d'AF2/AF3. Elle est conçue pour prioriser les conceptions destinées aux tests expérimentaux et prédire les taux de succès de liaison.

Installation rapide

Claude Code

Recommandé
Principal
npx skills add NeverSight/skills_feed -a claude-code
Commande PluginAlternatif
/plugin add https://github.com/NeverSight/skills_feed
Git CloneAlternatif
git clone https://github.com/NeverSight/skills_feed.git ~/.claude/skills/ipsae

Copiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence

Dépôt GitHub

NeverSight/skills_feed
Chemin: data/skills-md/adaptyvbio/protein-design-skills/ipsae
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learn-skillsskills

Compétences associées

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Autre

La compétence `protein-qc` fournit des métriques de contrôle qualité étayées par la recherche et des seuils de filtrage pour évaluer les conceptions de protéines. Elle aide les développeurs à vérifier les risques liés aux séquences, à calculer les propriétés biophysiques et d'interface, et à créer des pipelines de filtrage multi-étapes. Utilisez-la pour le pré-criblage des conceptions basé sur le pLDDT, l'ipTM, le PAE et d'autres références avant les tests expérimentaux.

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Cette compétence fournit des conseils d'expert pour la planification, le dépannage et l'interprétation des expériences de liaison par Résonance des Plasmons de Surface (SPR) et par Interférométrie à Couche Biologique (BLI). Elle aide les développeurs à choisir entre les plateformes SPR et BLI en utilisant une matrice de décision détaillée basée sur des facteurs tels que la sensibilité, le débit et les exigences de l'échantillon. Utilisez-la lors de la conception d'études cinétiques ou de l'analyse d'artefacts dans les données de liaison.

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Cette compétence fournit des conseils pour planifier et résoudre les problèmes des expériences de cinétique de liaison SPR et BLI. Elle aide les développeurs à choisir entre les plateformes, à interpréter les artefacts des données et à résoudre les signaux de liaison médiocres. Les principales fonctionnalités incluent une matrice décisionnelle comparant SPR/BLI et un dépannage pour les problèmes expérimentaux courants.

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Cette compétence fournit une expertise pour planifier, résoudre les problèmes et interpréter les expériences de cinétique de liaison par Résonance des Plasmons de Surface (SPR) et Interférométrie à Couche Biologique (BLI). Elle aide les développeurs à choisir entre les plateformes SPR et BLI en utilisant une matrice de décision détaillée et propose des solutions pour les problèmes courants tels qu'un faible signal ou des artefacts de données. Utilisez-la lors de la conception ou de la validation de tests de liaison pour garantir des résultats expérimentaux robustes.

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