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create-r-package

pjt222
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Métaaitesting

À propos

Cette Skill Claude échafaude une structure complète de package R prête pour la production à partir de zéro, en suivant les conventions usethis et le style tidyverse. Elle génère automatiquement les fichiers essentiels pour le DESCRIPTION, la documentation, les tests, la gestion des dépendances (renv), le contrôle de version et l'intégration continue/déploiement continu (CI/CD) avec GitHub Actions. Utilisez-la pour initialiser un nouveau package, convertir des scripts épars en un projet structuré, ou créer un squelette de package collaboratif.

Installation rapide

Claude Code

Recommandé
Principal
npx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code
Commande PluginAlternatif
/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanac
Git CloneAlternatif
git clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/create-r-package

Copiez et collez cette commande dans Claude Code pour installer cette compétence

Documentation

Create R Package

Scaffold fully configured R package with modern tooling and best practices.

When Use

  • Starting new R package from scratch
  • Converting loose R scripts into package
  • Setting up package skeleton for collaborative development

Inputs

  • Required: Package name (lowercase, no special chars except .)
  • Required: One-line description of package purpose
  • Optional: License type (default: MIT)
  • Optional: Author info (name, email, ORCID)
  • Optional: Whether to init renv (default: yes)

Steps

Step 1: Create Package Skeleton

usethis::create_package("packagename")
setwd("packagename")

Got: Directory created with DESCRIPTION, NAMESPACE, R/, man/ subdirectories.

If fail: Confirm usethis installed (install.packages("usethis")). Check directory does not already exist.

Step 2: Configure DESCRIPTION

Edit DESCRIPTION with accurate metadata:

Package: packagename
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Authors@R:
    person("First", "Last", , "[email protected]", role = c("aut", "cre"),
           comment = c(ORCID = "0000-0000-0000-0000"))
Description: One paragraph describing what the package does. Must be more
    than one sentence. Avoid starting with "This package".
License: MIT + file LICENSE
Encoding: UTF-8
Roxygen: list(markdown = TRUE)
RoxygenNote: 7.3.2
URL: https://github.com/username/packagename
BugReports: https://github.com/username/packagename/issues

Got: Valid DESCRIPTION passing R CMD check with no metadata warnings.

If fail: R CMD check warns about DESCRIPTION fields? Verify Title in Title Case, Description more than one sentence, Authors@R uses valid person() syntax.

Step 3: Set Up Infrastructure

usethis::use_mit_license()
usethis::use_readme_md()
usethis::use_news_md()
usethis::use_testthat(edition = 3)
usethis::use_git()
usethis::use_github_action("check-standard")

Got: LICENSE, README.md, NEWS.md, tests/ directory, .git/ initialized, .github/workflows/ created.

If fail: Any usethis::use_*() function fails? Install missing dependency, rerun. .git/ already exists? use_git() skips init.

Step 4: Create Development Configuration

Create .Rprofile:

if (file.exists("renv/activate.R")) {
  source("renv/activate.R")
}

if (requireNamespace("mcptools", quietly = TRUE)) {
  mcptools::mcp_session()
}

Create .Renviron.example:

RSTUDIO_PANDOC="C:/Program Files/RStudio/resources/app/bin/quarto/bin/tools"
# GITHUB_PAT=your_github_token_here

Create .Rbuildignore entries:

^\.Rprofile$
^\.Renviron$
^\.Renviron\.example$
^renv$
^renv\.lock$
^CLAUDE\.md$
^\.github$
^.*\.Rproj$

Got: .Rprofile, .Renviron.example, .Rbuildignore created. Development files dropped from built package.

If fail: .Rprofile causes startup errors? Check syntax. Confirm requireNamespace() guards stop failures when optional packages missing.

Step 5: Initialize renv

renv::init()

Got: renv/ directory and renv.lock created. Project-local library active.

If fail: Install renv with install.packages("renv"). renv hangs during init? Check network. Set options(timeout = 600).

Step 6: Create Package Documentation File

Create R/packagename-package.R:

#' @keywords internal
"_PACKAGE"

## usethis namespace: start
## usethis namespace: end
NULL

Got: R/packagename-package.R exists with "_PACKAGE" sentinel. Running devtools::document() generates package-level help.

If fail: Confirm filename matches pattern R/<packagename>-package.R. "_PACKAGE" string must be standalone expression, not inside function.

Step 7: Create CLAUDE.md

Create CLAUDE.md in project root with project-specific instructions for AI assistants.

Got: CLAUDE.md exists in project root with project-specific editing conventions, build commands, architecture notes.

If fail: Unsure what to include? Start with package name, one-line description, common dev commands (devtools::check(), devtools::test()), any non-obvious conventions.

Checks

  • devtools::check() returns 0 errors, 0 warnings
  • Package structure matches expected layout
  • .Rprofile loads without errors
  • renv::status() shows no issues
  • Git repo initialized with right .gitignore
  • GitHub Actions workflow file present

Pitfalls

  • Package name conflicts: Check CRAN with available::available("packagename") before committing to a name
  • Missing .Rbuildignore entries: Development files (.Rprofile, .Renviron, renv/) must drop from built package
  • Forgetting Encoding: Always include Encoding: UTF-8 in DESCRIPTION
  • RoxygenNote mismatch: Version in DESCRIPTION must match installed roxygen2

Examples

# Minimal creation
usethis::create_package("myanalysis")

# Full setup in one session
usethis::create_package("myanalysis")
usethis::use_mit_license()
usethis::use_testthat(edition = 3)
usethis::use_readme_md()
usethis::use_git()
usethis::use_github_action("check-standard")
renv::init()

See Also

  • write-roxygen-docs - document functions you create
  • write-testthat-tests - add tests for package
  • setup-github-actions-ci - detailed CI/CD configuration
  • manage-renv-dependencies - manage package dependencies
  • write-claude-md - create effective AI assistant instructions

Dépôt GitHub

pjt222/agent-almanac
Chemin: i18n/caveman/skills/create-r-package
0
agentsagentskillsai-assisted-developmentclaude-codeskillsteams

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