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samtools_mcp

By sirusb·Visit Source
ゲノムファイル処理のためのSAMtools MCP
2025年4月18日
1 month ago
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このMCPについて

このMCPは、SAM/BAM/CRAMゲノムアラインメントファイルを扱うための標準化されたインターフェースを提供し、フォーマット変換、ソート、インデックス作成、統計分析の機能を備えています。

使用方法

このMCPはDocker経由(推奨)またはローカルインストールで使用できます。アラインメントファイルに対するviewsortindexdepth計算などの一般的な操作のためのPythonメソッドを公開しています。

用途

このMCPにより、ゲノム研究者はプログラムでアラインメントファイルを処理できます。具体的には、フォーマット変換、特定領域の分析、リードフィルタリング、SAM/BAM/CRAMファイルの包括的な統計生成などが可能です。

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Last Updated: 3 months ago