samtools_mcp
유전체 파일 처리를 위한 SAMtools MCP. samtools_mcp is a Model Context Protocol (MCP) server maintained by sirusb. It connects to MCP-compatible clients such as Claude Desktop, Cursor, Cline, and other agents that speak the protocol. It exposes 8 tools, including view, sort, index, merge, depth, flagstat, idxstats and faidx, that an agent can call directly. It is categorized under Tool/Docker and Tool/CLI.
이 MCP는 무엇인가
이 MCP는 SAM/BAM/CRAM 유전체 정렬 파일 작업을 위한 표준화된 인터페이스를 제공하며, 형식 변환, 정렬, 인덱싱 및 통계 분석 기능을 제공합니다.
이 MCP 사용 방법
이 MCP는 Docker(권장) 또는 로컬 설치를 통해 사용할 수 있습니다. 정렬 파일에 대한view, sort, index 및 depth 계산과 같은 일반적인 작업을 위한 Python 메서드를 제공합니다.
이 MCP의 활용 용도
이 MCP는 유전체 연구자들이 프로그램 방식으로 정렬 파일을 처리할 수 있게 하며, 형식 변환, 특정 영역 분석, 읽기 필터링 및 SAM/BAM/CRAM 파일에 대한 포괄적인 통계 생성이 가능합니다.
AIMCP authority
DR and traffic signal for the AIMCP public domain.
Frequently asked questions
What is the samtools_mcp MCP server?
samtools_mcp is a Model Context Protocol server from sirusb. It lets MCP-compatible AI clients call its tools over a standard interface, so agents like Claude, Cursor, and Cline can use it without custom integration.
How do I connect samtools_mcp to my AI client?
Add samtools_mcp to your client's MCP configuration using the stdio or SSE connection shown in the usage examples on this page, then restart the client to load the server.
What tools does samtools_mcp provide?
samtools_mcp provides 8 tools: view, sort, index, merge, depth, flagstat, idxstats and faidx.
Is samtools_mcp free to use?
samtools_mcp is listed on AIMCP for free. Any API keys or accounts required by the underlying service are set by its provider.
Vernclaw Plugins for OpenClaw
Ready-to-use connectors for SEO data, social reading & content generation. Pay-as-you-go credits with audit logs.