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containerize-mcp-server

pjt222
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This skill containerizes R-based MCP servers using Docker, enabling deployment without local R installations. It handles mcptools integration, port configuration, and transport modes (stdio/HTTP) while connecting Claude Code to the containerized server. Use it for reproducible environments, running alongside other containerized services, or distributing MCP servers to other developers.

Quick Install

Claude Code

Recommended
Primary
npx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code
Plugin CommandAlternative
/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanac
Git CloneAlternative
git clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/containerize-mcp-server

Copy and paste this command in Claude Code to install this skill

Documentation


name: containerize-mcp-server description: > Containerisiere einen R-basierten MCP-Server (Model Context Protocol) mit Docker. Umfasst mcptools-Integration, Port-Freigabe, stdio- vs. HTTP-Transport und die Verbindung von Claude Code mit dem containerisierten Server. Verwende diesen Skill beim Deployen eines R-MCP-Servers ohne lokale R-Installation, beim Erstellen einer reproduzierbaren MCP-Server-Umgebung, beim Betrieb von MCP-Servern neben anderen containerisierten Diensten oder beim Verteilen eines MCP-Servers an andere Entwickler. license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: containerization complexity: advanced language: Docker tags: docker, mcp, mcptools, claude, container locale: de source_locale: en source_commit: 6f65f316 translator: claude-sonnet-4-6 translation_date: 2026-03-16

MCP-Server containerisieren

Einen R-MCP-Server in einen Docker-Container fuer portables Deployment verpacken.

Wann verwenden

  • Deployen eines R-MCP-Servers ohne lokale R-Installation
  • Erstellen einer reproduzierbaren MCP-Server-Umgebung
  • Betrieb von MCP-Servern neben anderen containerisierten Diensten
  • Verteilen eines MCP-Servers an andere Entwickler

Eingaben

  • Erforderlich: R-MCP-Server-Implementierung (mcptools-basiert oder benutzerdefiniert)
  • Erforderlich: Docker installiert und laufend
  • Optional: Zusaetzliche R-Pakete, die der Server benoetigt
  • Optional: Transportmodus (stdio oder HTTP)

Vorgehensweise

Schritt 1: Dockerfile fuer MCP-Server erstellen

FROM rocker/r-ver:4.5.0

# Systemabhaengigkeiten installieren
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    libcurl4-openssl-dev \
    libssl-dev \
    libxml2-dev \
    libgit2-dev \
    libssh2-1-dev \
    git \
    curl \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*

# R-Pakete installieren
RUN R -e "install.packages(c( \
    'remotes', \
    'ellmer' \
    ), repos='https://cloud.r-project.org/')"

# mcptools installieren
RUN R -e "remotes::install_github('posit-dev/mcptools')"

# Arbeitsverzeichnis setzen
WORKDIR /workspace

# MCP-Server-Ports freigeben
EXPOSE 3000 3001 3002

# Umgebungsvariablen
ENV R_LIBS_USER=/workspace/renv/library
ENV RENV_PATHS_CACHE=/workspace/renv/cache

# Standard: MCP-Server starten
CMD ["R", "-e", "mcptools::mcp_server()"]

Erwartet: Ein Dockerfile existiert im Projektstamm mit rocker/r-ver-Basisimage, Systemabhaengigkeiten, mcptools-Installation und dem MCP-Server als Standardbefehl.

Bei Fehler: Sicherstellen, dass das Basisimage-Tag zur R-Version passt. Wenn remotes::install_github fehlschlaegt, pruefen, ob git und libgit2-dev im Systemabhaengigkeiten-Layer enthalten sind.

Schritt 2: docker-compose.yml erstellen

version: '3.8'

services:
  mcp-server:
    build:
      context: .
      dockerfile: Dockerfile
    container_name: r-mcp-server
    image: r-mcp-server:latest

    volumes:
      - /path/to/projects:/workspace
      - renv-cache:/workspace/renv/cache

    stdin_open: true
    tty: true

    network_mode: "host"

    environment:
      - TERM=xterm-256color
      - R_LIBS_USER=/workspace/renv/library

    restart: unless-stopped

volumes:
  renv-cache:
    driver: local

Die Verwendung von network_mode: "host" stellt sicher, dass die MCP-Server-Ports auf localhost erreichbar sind.

Erwartet: Eine docker-compose.yml-Datei im Projektstamm mit dem MCP-Server-Dienst, Volume-Mounts fuer Projektdateien und renv-Cache sowie aktiviertem stdin_open/tty fuer stdio-Transport.

Bei Fehler: Wenn Volume-Pfade ungueltig sind, /path/to/projects an das tatsaechliche Projektverzeichnis anpassen. Unter Windows/WSL /mnt/c/...- oder /mnt/d/...-Pfade verwenden.

Schritt 3: Bauen und Starten

docker compose build
docker compose up -d

Erwartet: Container startet mit laufendem MCP-Server.

Bei Fehler: Logs mit docker compose logs mcp-server pruefen. Haeufige Probleme:

  • Fehlende R-Pakete: Zum Dockerfile-RUN-Installationsschritt hinzufuegen
  • Port bereits belegt: Freigegebenen Port aendern oder kollidierenden Dienst stoppen

Schritt 4: Claude Code mit Container verbinden

Fuer stdio-Transport (Container muss mit stdin weiterlaufen):

claude mcp add r-mcp-docker stdio "docker" "exec" "-i" "r-mcp-server" "R" "-e" "mcptools::mcp_server()"

Fuer HTTP-Transport (wenn der MCP-Server dies unterstuetzt):

{
  "mcpServers": {
    "r-mcp-docker": {
      "type": "http",
      "url": "http://localhost:3000/mcp"
    }
  }
}

Erwartet: Die MCP-Konfiguration von Claude Code enthaelt den r-mcp-docker-Servereintrag, und claude mcp list zeigt den neuen Server.

Bei Fehler: Fuer stdio-Transport sicherstellen, dass der Containername uebereinstimmt (r-mcp-server) und der Container mit docker ps laeuft. Fuer HTTP-Transport pruefen, ob der Port freigegeben und mit curl http://localhost:3000/mcp erreichbar ist.

Schritt 5: Verbindung ueberpruefen

# Pruefen, ob Container laeuft
docker ps | grep mcp-server

# R-Sitzung im Container testen
docker exec -it r-mcp-server R -e "sessionInfo()"

# Pruefen, ob mcptools verfuegbar ist
docker exec -it r-mcp-server R -e "library(mcptools)"

Erwartet: docker ps zeigt den r-mcp-server-Container als laufend, sessionInfo() gibt die erwartete R-Version zurueck, und library(mcptools) wird fehlerfrei geladen.

Bei Fehler: Wenn der Container nicht laeuft, docker compose logs mcp-server auf Startfehler pruefen. Wenn mcptools nicht geladen werden kann, das Image neu bauen, um sicherzustellen, dass das Paket korrekt installiert wurde.

Schritt 6: Benutzerdefinierte MCP-Tools hinzufuegen

Um projektspezifische MCP-Tools hinzuzufuegen, R-Skripte einhaengen:

volumes:
  - ./mcp-tools:/mcp-tools

Und im CMD laden:

CMD ["R", "-e", "source('/mcp-tools/custom_tools.R'); mcptools::mcp_server()"]

Erwartet: Benutzerdefinierte R-Skripte sind im Container unter /mcp-tools/ zugaenglich, und der MCP-Server laedt sie beim Start neben den Standardtools.

Bei Fehler: Sicherstellen, dass der Volume-Mount-Pfad korrekt ist, mit docker exec -it r-mcp-server ls /mcp-tools/ pruefen. Wenn Skripte nicht gesourced werden koennen, fehlende Paketabhaengigkeiten in den benutzerdefinierten Tools pruefen.

Validierung

  • Container wird fehlerfrei gebaut
  • MCP-Server startet im Container
  • Claude Code kann sich mit dem containerisierten Server verbinden
  • MCP-Tools antworten korrekt auf Anfragen
  • Container startet sauber neu
  • Volume-Mounts ermoeglichen Zugriff auf Projektdateien

Haeufige Fehler

  • stdin/tty-Anforderungen: MCP-stdio-Transport erfordert stdin_open: true und tty: true
  • Netzwerkisolation: Standard-Docker-Netzwerk kann Localhost-Zugriff verhindern. network_mode: "host" verwenden oder bestimmte Ports freigeben.
  • Paketversionen: mcptools auf einen bestimmten Commit fuer Reproduzierbarkeit pinnen.
  • Grosse Image-Groesse: mcptools + Abhaengigkeiten koennen gross sein. Multi-Stage-Builds fuer Produktion in Betracht ziehen.
  • Windows-Docker-Pfade: Bei Docker Desktop unter Windows mit WSL unterscheidet sich das Pfad-Mapping.

Verwandte Skills

  • create-r-dockerfile - Basis-Dockerfile-Muster fuer R
  • setup-docker-compose - Details zur Compose-Konfiguration
  • configure-mcp-server - MCP-Server-Konfiguration ohne Docker
  • troubleshoot-mcp-connection - Debugging von MCP-Verbindungsproblemen

GitHub Repository

pjt222/agent-almanac
Path: i18n/de/skills/containerize-mcp-server
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