generate-statistical-tables
About
This skill generates publication-ready statistical tables in R using gt, kableExtra, or flextable. It creates descriptive statistics, regression/ANOVA results, correlation matrices, and APA-formatted tables for academic papers. Use it when preparing statistical outputs for Quarto/R Markdown documents or manuscripts requiring formatted tables.
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Recommendednpx skills add pjt222/agent-almanac -a claude-code/plugin add https://github.com/pjt222/agent-almanacgit clone https://github.com/pjt222/agent-almanac.git ~/.claude/skills/generate-statistical-tablesCopy and paste this command in Claude Code to install this skill
Documentation
name: generate-statistical-tables description: > Generar tablas estadísticas listas para publicación usando gt, kableExtra o flextable. Cubre estadísticos descriptivos, resultados de regresión, tablas ANOVA, matrices de correlación y formato APA. Usar al crear tablas de estadísticos descriptivos, formatear resultados de regresión o ANOVA, construir matrices de correlación, producir tablas estilo APA para artículos académicos o generar tablas para documentos Quarto y R Markdown. license: MIT allowed-tools: Read Write Edit Bash Grep Glob metadata: author: Philipp Thoss version: "1.0" domain: reporting complexity: intermediate language: R tags: r, tables, gt, statistics, publication locale: es source_locale: en source_commit: 6f65f316 translator: claude-sonnet-4-6 translation_date: 2026-03-16
Generar Tablas Estadísticas
Crear tablas estadísticas listas para publicación para informes y manuscritos.
Cuándo Usar
- Crear tablas de estadísticos descriptivos
- Formatear resultados de regresión o ANOVA
- Construir matrices de correlación
- Producir tablas estilo APA para artículos académicos
- Generar tablas para documentos Quarto/R Markdown
Entradas
- Requerido: Resultados de análisis estadístico (objetos de modelo, datos resumidos)
- Requerido: Formato de salida (HTML, PDF, Word)
- Opcional: Guía de estilo (APA, específica de revista)
- Opcional: Esquema de numeración de tablas
Procedimiento
Paso 1: Elegir Paquete de Tablas
| Paquete | Mejor para | Formatos |
|---|---|---|
gt | HTML, propósito general | HTML, PDF, Word |
kableExtra | Documentos LaTeX/PDF | PDF, HTML |
flextable | Documentos Word | Word, PDF, HTML |
gtsummary | Resúmenes clínicos/estadísticos | Todos vía gt/flextable |
Esperado: Un paquete de tablas seleccionado basado en el formato de salida y caso de uso. El paquete elegido está instalado y es cargable.
En caso de fallo: Si el paquete requerido no está instalado, ejecutar install.packages("gt") (o el paquete apropiado). Para gtsummary, tanto gt como gtsummary deben estar instalados.
Paso 2: Tabla de Estadísticos Descriptivos
library(gt)
descriptives <- data |>
group_by(group) |>
summarise(
n = n(),
M = mean(score, na.rm = TRUE),
SD = sd(score, na.rm = TRUE),
Min = min(score, na.rm = TRUE),
Max = max(score, na.rm = TRUE)
)
gt(descriptives) |>
tab_header(
title = "Table 1",
subtitle = "Descriptive Statistics by Group"
) |>
fmt_number(columns = c(M, SD), decimals = 2) |>
fmt_number(columns = c(Min, Max), decimals = 1) |>
cols_label(
group = "Group",
n = md("*n*"),
M = md("*M*"),
SD = md("*SD*")
)
Esperado: Un objeto tabla gt con medias, desviaciones estándar y conteos formateados agrupados por categoría. Los encabezados de columna usan notación estadística apropiada (M, SD, n en cursiva).
En caso de fallo: Si group_by() produce resultados inesperados, verificar que la variable de agrupación exista y tenga los niveles esperados. Si fmt_number() produce un error, asegurar que las columnas objetivo contengan datos numéricos.
Paso 3: Tabla de Resultados de Regresión
model <- lm(outcome ~ predictor1 + predictor2 + predictor3, data = data)
library(gtsummary)
tbl_regression(model) |>
bold_p() |>
add_glance_source_note(
include = c(r.squared, adj.r.squared, nobs)
) |>
modify_header(label = "**Predictor**") |>
modify_caption("Table 2: Regression Results")
Esperado: Una tabla de regresión gtsummary con valores p en negrita, estadísticos de ajuste del modelo (R-cuadrado, N) en una nota al pie, y un subtítulo descriptivo.
En caso de fallo: Si tbl_regression() falla, verificar que la entrada sea un objeto de modelo (p. ej., lm, glm). Si add_glance_source_note() produce errores, verificar que broom pueda procesar el modelo: broom::glance(model).
Paso 4: Matriz de Correlación
library(gt)
cor_matrix <- cor(data[, c("var1", "var2", "var3", "var4")],
use = "pairwise.complete.obs")
# Format lower triangle
cor_matrix[upper.tri(cor_matrix)] <- NA
as.data.frame(cor_matrix) |>
tibble::rownames_to_column("Variable") |>
gt() |>
fmt_number(decimals = 2) |>
sub_missing(missing_text = "") |>
tab_header(title = "Table 3", subtitle = "Correlation Matrix")
Esperado: Una matriz de correlación de triángulo inferior renderizada como tabla gt con triángulo superior en blanco, dos decimales y un subtítulo claro.
En caso de fallo: Si sub_missing() no oculta el triángulo superior, verificar que los valores NA se establecieron correctamente con cor_matrix[upper.tri(cor_matrix)] <- NA. Si las variables no son numéricas, cor() fallará; filtrar solo columnas numéricas primero.
Paso 5: Tabla ANOVA
aov_result <- aov(score ~ group * condition, data = data)
library(gtsummary)
tbl_anova <- broom::tidy(aov_result) |>
gt() |>
fmt_number(columns = c(sumsq, meansq, statistic), decimals = 2) |>
fmt_number(columns = p.value, decimals = 3) |>
cols_label(
term = "Source",
df = md("*df*"),
sumsq = md("*SS*"),
meansq = md("*MS*"),
statistic = md("*F*"),
p.value = md("*p*")
) |>
tab_header(title = "Table 4", subtitle = "ANOVA Results")
Esperado: Una tabla ANOVA formateada con columnas Fuente, df, SS, MS, F y p. Los términos de interacción están claramente etiquetados y los valores p están formateados a tres decimales.
En caso de fallo: Si broom::tidy(aov_result) produce columnas inesperadas, verificar que el modelo sea un objeto aov. Para sumas de cuadrados Tipo III, usar car::Anova(model, type = 3) en lugar de aov() base.
Paso 6: Guardar Tablas
# Save as HTML
gtsave(my_table, "table1.html")
# Save as Word
gtsave(my_table, "table1.docx")
# Save as PNG image
gtsave(my_table, "table1.png")
# For LaTeX/PDF (kableExtra)
kableExtra::save_kable(kable_table, "table1.pdf")
Esperado: Tabla guardada en el formato de archivo especificado (HTML, Word, PNG o PDF). El archivo de salida se abre correctamente en la aplicación apropiada.
En caso de fallo: Si gtsave() falla para formato Word, asegurar que el paquete webshot2 esté instalado. Para salida PDF vía kableExtra, asegurar que una distribución LaTeX (TinyTeX o MiKTeX) esté instalada.
Paso 7: Incrustar en Documento Quarto
```{r}
#| label: tbl-descriptives
#| tbl-cap: "Descriptive Statistics by Group"
gt(descriptives) |>
fmt_number(columns = c(M, SD), decimals = 2)
```
See @tbl-descriptives for summary statistics.
Esperado: La tabla se renderiza en línea en el documento Quarto con una etiqueta referenciable (@tbl-*) y un subtítulo apropiado. La tabla se adapta al formato de salida del documento automáticamente.
En caso de fallo: Si la tabla no se renderiza, verificar que la etiqueta del bloque comience con tbl- para referencias cruzadas en Quarto. Si el formato se pierde en PDF, cambiar de gt a kableExtra para salida basada en LaTeX.
Validación
- La tabla se renderiza correctamente en el formato objetivo (HTML, PDF, Word)
- Los números están formateados consistentemente (decimales, alineación)
- La notación estadística sigue la guía de estilo (cursivas, símbolos apropiados)
- La tabla tiene un subtítulo claro y numeración
- Los encabezados de columna son significativos
- Las notas/notas al pie explican abreviaturas o marcadores de significancia
Errores Comunes
- gt en PDF: gt tiene soporte limitado para PDF. Usar kableExtra para documentos con mucho LaTeX.
- Inconsistencia en redondeo: Siempre usar
fmt_number()(gt) oformat()en lugar deround()para visualización - Visualización de valores faltantes: Configurar con
sub_missing()en gt ooptions(knitr.kable.NA = "") - Tablas anchas en PDF: Las tablas que exceden el ancho de página necesitan
landscape()o reducción del tamaño de fuente - Formato numérico APA: Sin cero inicial para valores acotados por 1 (valores p, correlaciones): ".03" no "0.03"
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