interpret-mass-spectrum
について
このスキルは、質量スペクトルを体系的に解釈し、分子式の決定、フラグメンテーション経路の特定、分子構造の提案を行います。イオン化法、分子イオン、同位体パターン、一般的なフラグメンテーションによる損失を分析します。質量分析データから構造情報を導き出したい場合、化合物の同一性を確認したい場合、または不純物を特定したい場合にご利用ください。
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ドキュメント
解質譜
析任一常見離子化法之質譜,以定分子離子、分子式、碎裂路徑、及分析物之結構特徵。
用時
- 定未知化合之分子量與分子式
- 以分子離子與碎裂證合成物之同
- 辨樣品中之雜質或降解物
- 自特徵碎裂損失提結構特徵
- 析同位素型以察鹵、硫、金屬
入
- 必要:質譜數據(m/z 值及相對強度,至少全掃描光譜)
- 必要:所用離子化法(EI、ESI、MALDI、CI、APCI、APPI)
- 可選:高解析質譜數據(精確質量,實測對理論)
- 可選:他源所得分子式(元素分析、NMR)
- 可選:串聯 MS/MS 數據(所選前驅離子之碎裂)
- 可選:層析脈絡(LC-MS 或 GC-MS 保留時間、純度)
法
第一步:辨離子化法與預期離子型
指諸峰前,定光譜所含之離子種:
- 分類離子化法:
| 法 | 能 | 主離子 | 碎裂 | 常用 |
|---|---|---|---|---|
| EI (70 eV) | 硬 | M+.(自由基陽離子) | 繁 | 小揮發分子、GC-MS |
| CI | 軟 | [M+H]+、[M+NH4]+ | 微 | 分子量之證 |
| ESI | 軟 | [M+H]+、[M+Na]+、[M-H]- | 微 | 極性、生物分子、LC-MS |
| MALDI | 軟 | [M+H]+、[M+Na]+、[M+K]+ | 微 | 大分子、聚合物、蛋白 |
| APCI | 軟 | [M+H]+、[M-H]- | 有 | 中極性、LC-MS |
- 記極性模式:正模生陽離子;負模生陰離子。ESI 常兼用
- 察加成物與簇:軟離子化常生 [M+Na]+(M+23)、[M+K]+(M+39)、[2M+H]+、[2M+Na]+,與 [M+H]+ 並現。指分子離子前先辨此
- 辨多電荷離子:ESI 中,多電荷離子現於 m/z = (M + nH) / n。尋以分數 m/z 隔之峰(如 0.5 Da 隔示 z=2)
**得:**離子化法有記,預期離子型列之,加成物與簇有辨,真分子離子可定。
**敗則:**若離子化法未知,察光譜之兆:繁碎裂暗 EI,加成型暗 ESI,基質峰暗 MALDI。儀器日誌可得則閱之。
第二步:定分子離子與分子式
辨分子離子峰並導分子式:
- 尋分子離子 (M):EI 中,M+. 乃最高 m/z 峰而具合理同位素型(易降解物或弱或闕)。軟離子化中,辨 [M+H]+ 或 [M+Na]+ 並減加成以得 M
- 用氮律:奇分子量示奇數氮原子;偶分子量示無或偶數氮原子
- 算不飽和度 (DBE):DBE = (2C + 2 + N - H - X) / 2,X 為鹵。每環或 π 鍵貢獻一 DBE。苯 = 4 DBE,羰基 = 1 DBE
- 用高解析數據:若精確質量可得,以質量虧損算分子式。比實測質量於質量準確度窗內(現代儀器常 < 5 ppm)之諸候選式
- 以同位素型交叉驗:觀測同位素型須配所提分子式(見第三步)
**得:**分子離子已辨,分子量已定,氮律已用,分子式有提(HRMS 可得則證之)。
**敗則:**若 EI 中無分子離子可見(熱敏或高分支化合常見),試較軟之離子化法。若分子離子曖,察最高 m/z 峰之常見小碎片損失(如 M-1、M-15、M-18 可助辨 M)。
第三步:析同位素型
以同位素特徵察特定元素:
- 單同位素元素:H、C、N、O、F、P、I 有特徵自然豐度型。唯含 C、H、N、O 者,M+1 峰約每碳 1.1%
- 鹵素型:
| 元素 | 同位素 | M : M+2 比 | 視覺型 |
|---|---|---|---|
| 35Cl / 37Cl | 35、37 | 3 : 1 | 雙峰,隔 2 Da |
| 79Br / 81Br | 79、81 | 1 : 1 | 等雙峰,隔 2 Da |
| 2 Cl | -- | 9 : 6 : 1 | 三峰 |
| 2 Br | -- | 1 : 2 : 1 | 三峰 |
| 1 Cl + 1 Br | -- | 3 : 4 : 1 | 特徵似四峰 |
- 硫之檢測:34S 於 M+2 貢獻 4.4%。M+2 峰相對 M 約 4--5%(校 13C2 貢獻後)示一硫原子
- 矽之檢測:29Si (5.1%) 與 30Si (3.4%) 生特徵 M+1 與 M+2 貢獻
- 比理論型:以所提分子式算理論同位素型。疊於觀測型以證或駁式
**得:**同位素型已析,Cl、Br、S、Si 有無已定,型合所提分子式。
**敗則:**若同位素解析不足(低解析儀器),M+2 型或不可解。記此限,依精確質量與他光譜數據定元素組成。
第四步:辨碎裂損失與關鍵碎片離子
圖碎裂路徑以提結構資訊:
- 錄諸大碎片:列相對強度 5--10% 以上之峰及其 m/z
- 自分子離子算中性損失:
| 損失 (Da) | 所失中性 | 結構暗示 |
|---|---|---|
| 1 | H. | 易脫氫 |
| 15 | CH3. | 甲基 |
| 17 | OH. | 羥基 |
| 18 | H2O | 醇、羧酸 |
| 27 | HCN | 氮雜環、胺 |
| 28 | CO 或 C2H4 | 羰基或乙基 |
| 29 | CHO. 或 C2H5. | 醛或乙基 |
| 31 | OCH3. 或 CH2OH. | 甲氧或羥甲 |
| 32 | CH3OH | 甲酯 |
| 35/36 | Cl./HCl | 含氯化合 |
| 44 | CO2 | 羧酸、酯 |
| 45 | OC2H5. | 乙氧 |
| 46 | NO2. | 硝基化合 |
- 辨特徵碎片離子:
| m/z | 離子 | 源 |
|---|---|---|
| 77 | C6H5+ | 苯基陽離子 |
| 91 | C7H7+ | 鎓離子(苄基重排) |
| 105 | C6H5CO+ | 苯甲醯陽離子 |
| 43 | CH3CO+ 或 C3H7+ | 乙醯或丙基 |
| 57 | C4H9+ 或 C3H5O+ | 叔丁基或丙烯醛 |
| 149 | 鄰苯二甲酸酯片段 | 塑化劑污染 |
- 圖碎裂路徑:以相繼損失連碎片離子,自 M 至低質量碎片建碎裂樹
- 辨重排離子:McLafferty 重排(γ-氫轉與 β-斷裂)自含羰基化合生偶電子離子。逆 Diels-Alder 碎裂乃環己烯系統之特徵
**得:**諸大碎片離子皆歸,中性損失算之並與結構特徵相關,碎裂樹已建。
**敗則:**若碎片不合自分子離子之簡單損失,慮重排過程。未歸碎片或示未預期之官能團、雜質、或基質/背景峰。
第五步:評純度並提結構
評全譜之純度兆並匯結構之提:
- 純度之察:GC-MS 或 LC-MS 中察層析圖有無餘峰。直接注入 MS 中察非主分析物之碎片或加成之意外離子
- 背景與污染峰:常見污染含鄰苯二甲酸酯塑化劑(m/z 149、167、279)、柱流失(GC-MS 中矽氧烷於 m/z 207、281、355、429)、溶劑簇
- 結構之提:合分子式(第二步)、同位素型(第三步)、碎裂(第四步)以提一結構或候選結構集
- 候選之序:以碎裂樹序結構候選。最善之結構以最少臨時假設釋最多碎片離子
- 交叉驗:比所提結構於他法(NMR、IR、UV-Vis)之數據。質譜獨鮮為新化合提無歧之結構
**得:**純度已評,污染若有則辨之,結構之提(或序之候選列)合諸 MS 數據,可則交叉驗。
**敗則:**若光譜似含多組分而未層析分離,標此混合並薦 LC-MS 或 GC-MS 重析。若無滿結構之提,辨何添數據(HRMS、MS/MS、NMR)可解曖。
驗
- 離子化法已辨,預期離子型有記
- 分子離子已定,別於加成、碎片、簇
- 氮律已用,合所提式
- 不飽和度已算,於結構中有校
- 同位素型合所提分子式
- 諸大碎片離子有歸,附中性損失與結構理由
- 碎裂樹自分子離子至低質量碎片已建
- 常見污染與背景峰已辨並除
- 結構之提與他光譜數據交叉驗
陷
- 誤辨分子離子:EI 中,基峰常為碎片非分子離子。分子離子乃最高 m/z 峰而具合理同位素型。ESI 中加成離子([M+Na]+、[2M+H]+)亦或誤為分子離子
- 忽氮律:奇質量分子離子需奇數氮。忘此致不可能之分子式
- 混同量損失:28 Da 之損或為 CO 或 C2H4;29 或為 CHO 或 C2H5。高解析 MS 或添碎裂數據乃可別
- 略多電荷離子:ESI 中二或三電荷離子現於半或三分之一之預期 m/z。尋同位素峰間之非整數隔,為多電荷之診
- 過度解讀低豐度峰:相對強度下 1--2% 者或為噪、同位素貢獻、或微污染,非有義之碎片
- 假設純樣:現實多光譜乃混合。恆察層析純度,尋不合所提結構之離子
參
interpret-nmr-spectrum— 定連結與氫環境以證結構interpret-ir-spectrum— 辨釋觀測碎裂之官能團interpret-uv-vis-spectrum— 述分析物中之發色團interpret-raman-spectrum— 互補振動析plan-spectroscopic-analysis— 數據採集前擇並序分析技術interpret-chromatogram— 析配 MS 之 GC 或 LC 層析數據
GitHub リポジトリ
関連スキル
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