ligandmpnn
关于
This skill uses LigandMPNN for protein sequence design specifically optimized for interactions with small molecules, cofactors, or metals. It's designed for specialized tasks like enzyme active site engineering and ligand binding pocket optimization. Developers should choose this over standard ProteinMPNN when designing sequences around any bound ligand or metal ion.
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推荐npx skills add NeverSight/skills_feed -a claude-code/plugin add https://github.com/NeverSight/skills_feedgit clone https://github.com/NeverSight/skills_feed.git ~/.claude/skills/ligandmpnn在 Claude Code 中复制并粘贴此命令以安装该技能
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boltz
其他Boltz是一个开源的生物分子结构预测工具，用于预测蛋白质复合物和蛋白质-配体复合物的三维结构。它特别适合作为AlphaFold2的开源替代方案，可用于验证设计的结合剂，并能利用本地GPU资源进行计算。开发者可在需要结构预测但希望使用开源工具时调用此技能。
alphafold
其他AlphaFold技能使用AlphaFold2进行蛋白质结构预测验证，适用于设计序列折叠验证、结合物-靶标复合物结构预测以及多链复合物预测等场景。它能计算pLDDT、pTM和ipTM等关键置信度指标，支持设计自洽性验证。对于更快的单链预测建议使用esm技能，质量控制阈值可参考protein-qc技能。
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bindcraft
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